Protein–RNA interactions for Protein: P40486

SHQ1, Protein SHQ1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHQ1P40486 NSR1YGR159C 1245 nt21.87■■□□□ 1.09
SHQ1P40486 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.77■■□□□ 1.08
SHQ1P40486 NOP1YDL014W 984 nt21.11■□□□□ 0.97
SHQ1P40486 MDJ1YFL016C 1536 nt19.82■□□□□ 0.76
SHQ1P40486 YKL036CYKL036C 393 nt19.6■□□□□ 0.73
SHQ1P40486 Q0297Q0297 156 nt18.48■□□□□ 0.55
SHQ1P40486 SRX1YKL086W 384 nt18.38■□□□□ 0.53
SHQ1P40486 YJL027CYJL027C 417 nt18.32■□□□□ 0.52
SHQ1P40486 SCS3YGL126W 1143 nt17.86■□□□□ 0.45
SHQ1P40486 YCR051WYCR051W 669 nt17.45■□□□□ 0.38
SHQ1P40486 DBP2YNL112W 1641 nt17.4■□□□□ 0.38
SHQ1P40486 YOL085CYOL085C 342 nt16.93■□□□□ 0.3
SHQ1P40486 YBR190WYBR190W 312 nt16.92■□□□□ 0.3
SHQ1P40486 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.81■□□□□ 0.28
SHQ1P40486 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.81■□□□□ 0.28
SHQ1P40486 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.81■□□□□ 0.28
SHQ1P40486 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.81■□□□□ 0.28
SHQ1P40486 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.81■□□□□ 0.28
SHQ1P40486 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.81■□□□□ 0.28
SHQ1P40486 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.81■□□□□ 0.28
SHQ1P40486 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.81■□□□□ 0.28
SHQ1P40486 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.81■□□□□ 0.28
SHQ1P40486 CCC1YLR220W 969 nt16.65■□□□□ 0.26
SHQ1P40486 PKP1YIL042C 1185 nt16.61■□□□□ 0.25
SHQ1P40486 RPP1BYDL130W 321 nt16.58■□□□□ 0.24
SHQ1P40486 RTC3YHR087W 336 nt16.55■□□□□ 0.24
SHQ1P40486 RVS167YDR388W 1449 nt16.2■□□□□ 0.18
SHQ1P40486 SCJ1YMR214W 1134 nt16.16■□□□□ 0.18
SHQ1P40486 ATS1YAL020C 1002 nt16.05■□□□□ 0.16
SHQ1P40486 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.79■□□□□ 0.12
SHQ1P40486 PET122YER153C 765 nt15.77■□□□□ 0.12
SHQ1P40486 SCR1SCR1 522 nt15.76■□□□□ 0.11
SHQ1P40486 PUT4YOR348C 1884 nt15.67■□□□□ 0.1
SHQ1P40486 SHR5YOL110W 714 nt15.58■□□□□ 0.08
SHQ1P40486 SSA3YBL075C 1950 nt15.42■□□□□ 0.06
SHQ1P40486 URN1YPR152C 1398 nt15.38■□□□□ 0.05
SHQ1P40486 RRN5YLR141W 1092 nt15.35■□□□□ 0.05
SHQ1P40486 DEP1YAL013W 1218 nt15.31■□□□□ 0.04
SHQ1P40486 ARE1YCR048W 1833 nt15.29■□□□□ 0.04
SHQ1P40486 YDJ1YNL064C 1230 nt15.24■□□□□ 0.03
SHQ1P40486 SAH1YER043C 1350 nt15.24■□□□□ 0.03
SHQ1P40486 OPI9YLR338W 858 nt15.21■□□□□ 0.03
SHQ1P40486 POA1YBR022W 534 nt15.16■□□□□ 0.02
SHQ1P40486 RSB1YOR049C 1065 nt15.12■□□□□ 0.01
SHQ1P40486 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.1■□□□□ 0.01
SHQ1P40486 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.04■□□□□ -0
SHQ1P40486 RPN10YHR200W 807 nt15.01□□□□□ -0.01
SHQ1P40486 GAR1YHR089C 618 nt15□□□□□ -0.01
SHQ1P40486 YNL208WYNL208W 600 nt14.97□□□□□ -0.01
SHQ1P40486 BSC6YOL137W 1494 nt14.89□□□□□ -0.03
SHQ1P40486 PST2YDR032C 597 nt14.83□□□□□ -0.04
SHQ1P40486 PUN1YLR414C 792 nt14.74□□□□□ -0.05
SHQ1P40486 BUD23YCR047C 828 nt14.71□□□□□ -0.05
SHQ1P40486 PTC2YER089C 1395 nt14.66□□□□□ -0.06
SHQ1P40486 YJR018WYJR018W 363 nt14.63□□□□□ -0.07
SHQ1P40486 TIR1YER011W 765 nt14.49□□□□□ -0.09
SHQ1P40486 NAB2YGL122C 1578 nt14.48□□□□□ -0.09
SHQ1P40486 SPT5YML010W 3192 nt14.46□□□□□ -0.1
SHQ1P40486 SSA1YAL005C 1929 nt14.43□□□□□ -0.1
SHQ1P40486 YJR120WYJR120W 351 nt14.41□□□□□ -0.1
SHQ1P40486 YKL097CYKL097C 411 nt14.38□□□□□ -0.11
SHQ1P40486 FIS1YIL065C 468 nt14.3□□□□□ -0.12
SHQ1P40486 DAL1YIR027C 1383 nt14.24□□□□□ -0.13
SHQ1P40486 FPR4YLR449W 1179 nt14.22□□□□□ -0.13
SHQ1P40486 RPP2BYDR382W 333 nt14.21□□□□□ -0.13
SHQ1P40486 SRB2YHR041C 633 nt14.19□□□□□ -0.14
SHQ1P40486 SHU1YHL006C 453 nt14.15□□□□□ -0.14
SHQ1P40486 PHO4YFR034C 939 nt14.13□□□□□ -0.15
SHQ1P40486 INM2YDR287W 879 nt14.12□□□□□ -0.15
SHQ1P40486 SSA4YER103W 1929 nt14.07□□□□□ -0.16
SHQ1P40486 MEP2YNL142W 1500 nt14□□□□□ -0.17
SHQ1P40486 YBL100CYBL100C 315 nt13.97□□□□□ -0.17
SHQ1P40486 YPS1YLR120C 1710 nt13.97□□□□□ -0.17
SHQ1P40486 BDH2YAL061W 1254 nt13.9□□□□□ -0.18
SHQ1P40486 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.85□□□□□ -0.19
SHQ1P40486 YDR095CYDR095C 411 nt13.83□□□□□ -0.2
SHQ1P40486 WWM1YFL010C 636 nt13.83□□□□□ -0.2
SHQ1P40486 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.83□□□□□ -0.2
SHQ1P40486 DCW1YKL046C 1350 nt13.82□□□□□ -0.2
SHQ1P40486 FUN26YAL022C 1554 nt13.8□□□□□ -0.2
SHQ1P40486 YGR021WYGR021W 873 nt13.73□□□□□ -0.21
SHQ1P40486 TRM9YML014W 840 nt13.68□□□□□ -0.22
SHQ1P40486 YOR139CYOR139C 393 nt13.68□□□□□ -0.22
SHQ1P40486 ALF1YNL148C 765 nt13.64□□□□□ -0.23
SHQ1P40486 NPL3YDR432W 1245 nt13.63□□□□□ -0.23
SHQ1P40486 LSM3YLR438C-A 270 nt13.63□□□□□ -0.23
SHQ1P40486 HOM6YJR139C 1080 nt13.61□□□□□ -0.23
SHQ1P40486 EMI2YDR516C 1503 nt13.59□□□□□ -0.23
SHQ1P40486 PTP1YDL230W 1008 nt13.58□□□□□ -0.24
SHQ1P40486 CCT6YDR188W 1641 nt13.57□□□□□ -0.24
SHQ1P40486 BDF1YLR399C 2061 nt13.56□□□□□ -0.24
SHQ1P40486 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.56□□□□□ -0.24
SHQ1P40486 RPP2AYOL039W 321 nt13.56□□□□□ -0.24
SHQ1P40486 CAC2YML102W 1407 nt13.54□□□□□ -0.24
SHQ1P40486 MNP1YGL068W 585 nt13.52□□□□□ -0.25
SHQ1P40486 YOL037CYOL037C 354 nt13.48□□□□□ -0.25
SHQ1P40486 YDL221WYDL221W 552 nt13.47□□□□□ -0.25
SHQ1P40486 SIS1YNL007C 1059 nt13.46□□□□□ -0.25
SHQ1P40486 YBR220CYBR220C 1683 nt13.46□□□□□ -0.26
SHQ1P40486 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.8 ms