RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570380.5

CTDNEP1-202, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-202ENST00000570380 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.04■■□□□ 1.92
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CTDNEP1-202ENST00000570380 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24■■□□□ 1.43
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CTDNEP1-202ENST00000570380 NACADO15069 1562 aa23.29■■□□□ 1.32
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CTDNEP1-202ENST00000570380 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.62■■□□□ 1.21
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CTDNEP1-202ENST00000570380 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1-202ENST00000570380 SCRIBQ14160 1630 aa22.31■■□□□ 1.16
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CTDNEP1-202ENST00000570380 SMARCA4P51532 1647 aa21.23■□□□□ 0.99
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CTDNEP1-202ENST00000570380 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.12■□□□□ 0.97
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CTDNEP1-202ENST00000570380 OSCARQ8IYS5 282 aa20.68■□□□□ 0.9
CTDNEP1-202ENST00000570380 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.65■□□□□ 0.9
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CTDNEP1-202ENST00000570380 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.58■□□□□ 0.89
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CTDNEP1-202ENST00000570380 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.53■□□□□ 0.88
CTDNEP1-202ENST00000570380 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.53■□□□□ 0.88
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CTDNEP1-202ENST00000570380 FAM69CQ0P6D2 419 aa19.24■□□□□ 0.67
CTDNEP1-202ENST00000570380 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
CTDNEP1-202ENST00000570380 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa19.23■□□□□ 0.67
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