RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570380.5

CTDNEP1-202, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CTDNEP1-202ENST00000570380 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24■■□□□ 1.43
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CTDNEP1-202ENST00000570380 NACADO15069 1562 aa23.29■■□□□ 1.32
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CTDNEP1-202ENST00000570380 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.97■■□□□ 1.27
CTDNEP1-202ENST00000570380 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1-202ENST00000570380 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.6■■□□□ 1.21
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CTDNEP1-202ENST00000570380 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CTDNEP1-202ENST00000570380 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1-202ENST00000570380 SCRIBQ14160 1630 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDNEP1-202ENST00000570380 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CTDNEP1-202ENST00000570380 CUX2O14529 1486 aa21.77■■□□□ 1.08
CTDNEP1-202ENST00000570380 ERCC6Q03468 1493 aa21.62■■□□□ 1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 NCAPD3P42695 1498 aa21.5■■□□□ 1.03
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CTDNEP1-202ENST00000570380 HMGXB3Q12766 1538 aa21.29■■□□□ 1
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CTDNEP1-202ENST00000570380 SMARCA4P51532 1647 aa21.23■□□□□ 0.99
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CTDNEP1-202ENST00000570380 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.12■□□□□ 0.97
CTDNEP1-202ENST00000570380 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.11■□□□□ 0.97
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CTDNEP1-202ENST00000570380 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.84■□□□□ 0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 WDR62O43379 1518 aa20.83■□□□□ 0.92
CTDNEP1-202ENST00000570380 CADPSQ9ULU8 1353 aa20.81■□□□□ 0.92
CTDNEP1-202ENST00000570380 OSCARQ8IYS5 282 aa20.68■□□□□ 0.9
CTDNEP1-202ENST00000570380 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.65■□□□□ 0.9
CTDNEP1-202ENST00000570380 WIZO95785 1651 aa20.61■□□□□ 0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.58■□□□□ 0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.53■□□□□ 0.88
CTDNEP1-202ENST00000570380 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.53■□□□□ 0.88
CTDNEP1-202ENST00000570380 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.53■□□□□ 0.88
CTDNEP1-202ENST00000570380 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CTDNEP1-202ENST00000570380 CFTRP13569 1480 aa20.47■□□□□ 0.87
CTDNEP1-202ENST00000570380 ARHGEF11O15085 1522 aa20.38■□□□□ 0.85
CTDNEP1-202ENST00000570380 PRDM2Q13029 1718 aa20.31■□□□□ 0.84
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CTDNEP1-202ENST00000570380 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 IFT140Q96RY7 1462 aa20.24■□□□□ 0.83
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CTDNEP1-202ENST00000570380 CHD1O14646 1710 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDNEP1-202ENST00000570380 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CTDNEP1-202ENST00000570380 ARAP1Q96P48 1450 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDNEP1-202ENST00000570380 TOPBP1Q92547 1522 aa20.15■□□□□ 0.82
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CTDNEP1-202ENST00000570380 ABCC8Q09428 1581 aa20.04■□□□□ 0.8
CTDNEP1-202ENST00000570380 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.02■□□□□ 0.8
CTDNEP1-202ENST00000570380 FBLN2P98095 1184 aa19.99■□□□□ 0.79
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CTDNEP1-202ENST00000570380 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
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CTDNEP1-202ENST00000570380 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa19.81■□□□□ 0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 SYNJ1O43426 1573 aa19.79■□□□□ 0.76
CTDNEP1-202ENST00000570380 SOGA1O94964 1423 aa19.79■□□□□ 0.76
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CTDNEP1-202ENST00000570380 GAPVD1Q14C86 1478 aa19.68■□□□□ 0.74
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CTDNEP1-202ENST00000570380 ADAMTS12P58397 1594 aa19.37■□□□□ 0.69
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CTDNEP1-202ENST00000570380 FAM69CQ0P6D2 419 aa19.24■□□□□ 0.67
CTDNEP1-202ENST00000570380 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
CTDNEP1-202ENST00000570380 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa19.23■□□□□ 0.67
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