Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 CHD6-205ENST00000440697 1635 ntTSL 57.94□□□□□ -1.143e-7■■■■■ 30.5
PUM1Q14671 CHD6-201ENST00000309279 1635 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.143e-7■■■■■ 30.5
PUM1Q14671 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.413e-7■■■■■ 30.5
PUM1Q14671 PDS5B-207ENST00000482955 581 ntTSL 322.49■■□□□ 1.192e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.452e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.172e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.122e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 CCDC25-202ENST00000517979 877 ntTSL 1 (best)14.3□□□□□ -0.122e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 COX17-202ENST00000468918 555 ntTSL 414.17□□□□□ -0.142e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.272e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.282e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.282e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 PDS5B-208ENST00000493653 972 ntTSL 1 (best)12.6□□□□□ -0.392e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 COX17-201ENST00000261070 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.422e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 COX17-205ENST00000490145 513 ntTSL 512.28□□□□□ -0.442e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 TFDP2-215ENST00000489671 9857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.512e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 EIF3K-209ENST00000590134 711 ntTSL 210.04□□□□□ -0.82e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 COX17-203ENST00000484810 471 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.822e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 LARP7-201ENST00000324052 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.872e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 TFDP2-209ENST00000477292 1403 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.882e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 TFDP2-222ENST00000495310 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.952e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 SH3BGRL-202ENST00000463546 755 ntTSL 28.87□□□□□ -0.992e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 LARP7-208ENST00000507443 753 ntTSL 58.55□□□□□ -1.042e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 TFDP2-224ENST00000499676 9335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.072e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 SH3BGRL-204ENST00000481106 928 ntTSL 1 (best)8.37□□□□□ -1.072e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 SH3BGRL-203ENST00000474113 739 ntTSL 38.18□□□□□ -1.12e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 LARP7-207ENST00000505216 477 ntTSL 38.01□□□□□ -1.132e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 LARP7-214ENST00000512589 556 ntTSL 47.69□□□□□ -1.182e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 TFDP2-213ENST00000487734 1469 ntTSL 57.62□□□□□ -1.192e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.242e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 TFDP2-212ENST00000486111 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.262e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.282e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 COX17-204ENST00000486606 430 ntTSL 36.93□□□□□ -1.32e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 LARP7-209ENST00000508577 579 ntTSL 46.88□□□□□ -1.312e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 CCDC25-203ENST00000519299 581 ntTSL 26.88□□□□□ -1.312e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 NCKAP1-204ENST00000477988 612 ntTSL 26.8□□□□□ -1.322e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 COX17-207ENST00000497997 565 ntTSL 26.4□□□□□ -1.382e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 LARP7-206ENST00000505034 1047 ntTSL 26.26□□□□□ -1.412e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.412e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 LARP7-215ENST00000513553 528 ntTSL 36.01□□□□□ -1.452e-7■■■■■ 30.4
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PUM1Q14671 LARP7-211ENST00000509622 2020 ntTSL 1 (best)5.96□□□□□ -1.462e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 CCDC25-205ENST00000519843 481 ntTSL 25.17□□□□□ -1.582e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.592e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 PDS5B-204ENST00000466078 1889 ntTSL 24.22□□□□□ -1.732e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 PDS5B-209ENST00000498550 4238 ntTSL 1 (best)3.51□□□□□ -1.852e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 PDS5B-203ENST00000450460 5246 ntTSL 1 (best)3.47□□□□□ -1.852e-7■■■■■ 30.4
PUM1Q14671 DRAP1-203ENST00000525190 474 nt23.69■■□□□ 1.388e-11■■■■■ 30.3
PUM1Q14671 EBNA1BP2-202ENST00000431635 1503 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.593e-20■■■■■ 30.1
PUM1Q14671 EBNA1BP2-201ENST00000236051 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.873e-20■■■■■ 30.1
PUM1Q14671 EBNA1BP2-204ENST00000463906 937 ntTSL 26.32□□□□□ -1.43e-20■■■■■ 30.1
PUM1Q14671 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.452e-7■■■■■ 30.1
PUM1Q14671 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.272e-7■■■■■ 30.1
PUM1Q14671 PSAP-201ENST00000394934 2830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.472e-7■■■■■ 30.1
PUM1Q14671 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.673e-7■■■■■ 29.9
PUM1Q14671 WBP2-205ENST00000586257 676 ntTSL 318.69■□□□□ 0.583e-7■■■■■ 29.9
PUM1Q14671 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.533e-7■■■■■ 29.9
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PUM1Q14671 BOP1-204ENST00000569403 651 ntTSL 427.16■■□□□ 1.941e-6■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.714e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 ABCA2-211ENST00000464520 886 ntTSL 225.51■■□□□ 1.674e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.594e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 MLST8-226ENST00000566835 1565 ntTSL 224.37■■□□□ 1.494e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.414e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 MLST8-230ENST00000568194 2116 ntTSL 1 (best)22.63■■□□□ 1.214e-7■■■■■ 29.1
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PUM1Q14671 SREBF1-210ENST00000471445 936 ntTSL 221.95■■□□□ 1.14e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.021e-6■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 MLST8-208ENST00000562392 1662 ntTSL 220.86■□□□□ 0.934e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.784e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.674e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.674e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 MLST8-212ENST00000563067 1646 ntTSL 519.05■□□□□ 0.644e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 ABCA2-217ENST00000479446 6295 ntTSL 1 (best)19.05■□□□□ 0.644e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.534e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.464e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 SPOUT1-202ENST00000466556 926 ntTSL 317.52■□□□□ 0.44e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 MLST8-221ENST00000565330 1403 ntTSL 217.16■□□□□ 0.344e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.324e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.264e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 MLST8-231ENST00000568542 1865 ntTSL 1 (best)16.69■□□□□ 0.264e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.244e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 ABCA2-220ENST00000490486 666 ntTSL 216.16■□□□□ 0.184e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.134e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.134e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 ARHGEF1-222ENST00000600517 428 ntTSL 313.81□□□□□ -0.24e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 HDAC1-203ENST00000463172 895 ntTSL 213.66□□□□□ -0.224e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.234e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.234e-7■■■■■ 29.1
PUM1Q14671 HDAC1-207ENST00000481281 721 ntTSL 513.42□□□□□ -0.264e-7■■■■■ 29.1
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