RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517979.1

CCDC25-202, Transcript of coiled-coil domain containing 25, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCDC25, Length 877 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CCDC25-202ENST00000517979 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.14■■■□□ 2.41
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CCDC25-202ENST00000517979 NACADO15069 1562 aa28.4■■■□□ 2.14
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CCDC25-202ENST00000517979 SMARCA2P51531 1590 aa26.15■■□□□ 1.78
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CCDC25-202ENST00000517979 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.56■■□□□ 1.68
CCDC25-202ENST00000517979 CUX2O14529 1486 aa25.53■■□□□ 1.68
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CCDC25-202ENST00000517979 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.41■■□□□ 1.66
CCDC25-202ENST00000517979 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.38■■□□□ 1.65
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CCDC25-202ENST00000517979 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.18■■□□□ 1.62
CCDC25-202ENST00000517979 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.16■■□□□ 1.62
CCDC25-202ENST00000517979 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.15■■□□□ 1.62
CCDC25-202ENST00000517979 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.12■■□□□ 1.61
CCDC25-202ENST00000517979 WDR62O43379 1518 aa25.1■■□□□ 1.61
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CCDC25-202ENST00000517979 PRDM2Q13029 1718 aa25.02■■□□□ 1.6
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CCDC25-202ENST00000517979 IFT140Q96RY7 1462 aa24.64■■□□□ 1.53
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CCDC25-202ENST00000517979 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
CCDC25-202ENST00000517979 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
CCDC25-202ENST00000517979 CUX1P39880 1505 aa24.42■■□□□ 1.5
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CCDC25-202ENST00000517979 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.39■■□□□ 1.5
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CCDC25-202ENST00000517979 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.38■■□□□ 1.49
CCDC25-202ENST00000517979 SOGA1O94964 1423 aa24.37■■□□□ 1.49
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CCDC25-202ENST00000517979 WDR97A6NE52 1622 aa24.25■■□□□ 1.47
CCDC25-202ENST00000517979 CHD1O14646 1710 aa24.2■■□□□ 1.46
CCDC25-202ENST00000517979 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.16■■□□□ 1.46
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CCDC25-202ENST00000517979 TRIM41Q8WV44 630 aa24.16■■□□□ 1.46
CCDC25-202ENST00000517979 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.16■■□□□ 1.46
CCDC25-202ENST00000517979 TOP2BQ02880 1626 aa24.13■■□□□ 1.45
CCDC25-202ENST00000517979 GRIN2BQ13224 1484 aa24.13■■□□□ 1.45
CCDC25-202ENST00000517979 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.13■■□□□ 1.45
CCDC25-202ENST00000517979 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.13■■□□□ 1.45
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CCDC25-202ENST00000517979 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.06■■□□□ 1.44
CCDC25-202ENST00000517979 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.06■■□□□ 1.44
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CCDC25-202ENST00000517979 ARHGEF11O15085 1522 aa24.03■■□□□ 1.44
CCDC25-202ENST00000517979 SYNJ2O15056 1496 aa24.01■■□□□ 1.43
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CCDC25-202ENST00000517979 ADAMTS12P58397 1594 aa23.88■■□□□ 1.41
CCDC25-202ENST00000517979 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.84■■□□□ 1.41
CCDC25-202ENST00000517979 GRIN2AQ12879 1464 aa23.82■■□□□ 1.4
CCDC25-202ENST00000517979 ARAP1Q96P48 1450 aa23.81■■□□□ 1.4
CCDC25-202ENST00000517979 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.81■■□□□ 1.4
CCDC25-202ENST00000517979 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.81■■□□□ 1.4
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