RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261070.6

COX17-201, Transcript of cytochrome c oxidase copper chaperone COX17, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COX17, Length 684 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX17-201ENST00000261070 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.68■■■□□ 2.18
COX17-201ENST00000261070 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.86■■□□□ 1.73
COX17-201ENST00000261070 ABCC9O60706 1549 aa25.6■■□□□ 1.69
COX17-201ENST00000261070 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.56■■□□□ 1.52
COX17-201ENST00000261070 NACADO15069 1562 aa24.44■■□□□ 1.5
COX17-201ENST00000261070 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
COX17-201ENST00000261070 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.23■■□□□ 1.47
COX17-201ENST00000261070 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.98■■□□□ 1.43
COX17-201ENST00000261070 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.91■■□□□ 1.42
COX17-201ENST00000261070 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.9■■□□□ 1.42
COX17-201ENST00000261070 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.86■■□□□ 1.41
COX17-201ENST00000261070 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
COX17-201ENST00000261070 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.78■■□□□ 1.4
COX17-201ENST00000261070 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.74■■□□□ 1.39
COX17-201ENST00000261070 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.73■■□□□ 1.39
COX17-201ENST00000261070 SCRIBQ14160 1630 aa23.31■■□□□ 1.32
COX17-201ENST00000261070 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.22■■□□□ 1.31
COX17-201ENST00000261070 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
COX17-201ENST00000261070 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.16■■□□□ 1.3
COX17-201ENST00000261070 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.01■■□□□ 1.27
COX17-201ENST00000261070 NCAPD3P42695 1498 aa22.54■■□□□ 1.2
COX17-201ENST00000261070 SMARCA2P51531 1590 aa22.4■■□□□ 1.18
COX17-201ENST00000261070 HMGXB3Q12766 1538 aa22.4■■□□□ 1.18
COX17-201ENST00000261070 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.39■■□□□ 1.17
COX17-201ENST00000261070 SMARCA4P51532 1647 aa22.36■■□□□ 1.17
COX17-201ENST00000261070 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
COX17-201ENST00000261070 CUX2O14529 1486 aa22.29■■□□□ 1.16
COX17-201ENST00000261070 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.28■■□□□ 1.16
COX17-201ENST00000261070 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.2■■□□□ 1.14
COX17-201ENST00000261070 ERCC6Q03468 1493 aa22.17■■□□□ 1.14
COX17-201ENST00000261070 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
COX17-201ENST00000261070 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.04■■□□□ 1.12
COX17-201ENST00000261070 MROH2BQ7Z745 1585 aa22■■□□□ 1.11
COX17-201ENST00000261070 NESP48681 1621 aa21.97■■□□□ 1.11
COX17-201ENST00000261070 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
COX17-201ENST00000261070 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.88■■□□□ 1.09
COX17-201ENST00000261070 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.8■■□□□ 1.08
COX17-201ENST00000261070 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.75■■□□□ 1.07
COX17-201ENST00000261070 WIZO95785 1651 aa21.72■■□□□ 1.07
COX17-201ENST00000261070 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.65■■□□□ 1.06
COX17-201ENST00000261070 WDR62O43379 1518 aa21.64■■□□□ 1.05
COX17-201ENST00000261070 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
COX17-201ENST00000261070 CFTRP13569 1480 aa21.58■■□□□ 1.04
COX17-201ENST00000261070 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
COX17-201ENST00000261070 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.55■■□□□ 1.04
COX17-201ENST00000261070 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.51■■□□□ 1.03
COX17-201ENST00000261070 PRDM2Q13029 1718 aa21.38■■□□□ 1.01
COX17-201ENST00000261070 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
COX17-201ENST00000261070 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.24■□□□□ 0.99
COX17-201ENST00000261070 ABCC8Q09428 1581 aa21.2■□□□□ 0.98
COX17-201ENST00000261070 IFT140Q96RY7 1462 aa21.16■□□□□ 0.98
COX17-201ENST00000261070 OSCARQ8IYS5 282 aa21.16■□□□□ 0.98
COX17-201ENST00000261070 TOPBP1Q92547 1522 aa21.1■□□□□ 0.97
COX17-201ENST00000261070 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.06■□□□□ 0.96
COX17-201ENST00000261070 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
COX17-201ENST00000261070 TRIM41Q8WV44 630 aa20.99■□□□□ 0.95
COX17-201ENST00000261070 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
COX17-201ENST00000261070 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
COX17-201ENST00000261070 WDR97A6NE52 1622 aa20.91■□□□□ 0.94
COX17-201ENST00000261070 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
COX17-201ENST00000261070 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.86■□□□□ 0.93
COX17-201ENST00000261070 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.86■□□□□ 0.93
COX17-201ENST00000261070 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.86■□□□□ 0.93
COX17-201ENST00000261070 ARHGEF11O15085 1522 aa20.83■□□□□ 0.92
COX17-201ENST00000261070 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.79■□□□□ 0.92
COX17-201ENST00000261070 SOGA1O94964 1423 aa20.77■□□□□ 0.91
COX17-201ENST00000261070 CHD1O14646 1710 aa20.75■□□□□ 0.91
COX17-201ENST00000261070 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.72■□□□□ 0.91
COX17-201ENST00000261070 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
COX17-201ENST00000261070 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.7■□□□□ 0.9
COX17-201ENST00000261070 CUX1P39880 1505 aa20.69■□□□□ 0.9
COX17-201ENST00000261070 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
COX17-201ENST00000261070 GRIN2BQ13224 1484 aa20.65■□□□□ 0.9
COX17-201ENST00000261070 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
COX17-201ENST00000261070 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.62■□□□□ 0.89
COX17-201ENST00000261070 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.61■□□□□ 0.89
COX17-201ENST00000261070 SYNJ1O43426 1573 aa20.6■□□□□ 0.89
COX17-201ENST00000261070 SYNJ2O15056 1496 aa20.6■□□□□ 0.89
COX17-201ENST00000261070 ARAP1Q96P48 1450 aa20.59■□□□□ 0.89
COX17-201ENST00000261070 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.58■□□□□ 0.88
COX17-201ENST00000261070 FBLN2P98095 1184 aa20.57■□□□□ 0.88
COX17-201ENST00000261070 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.55■□□□□ 0.88
COX17-201ENST00000261070 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
COX17-201ENST00000261070 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.54■□□□□ 0.88
COX17-201ENST00000261070 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.53■□□□□ 0.88
COX17-201ENST00000261070 PBRM1Q86U86 1689 aa20.51■□□□□ 0.87
COX17-201ENST00000261070 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
COX17-201ENST00000261070 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.45■□□□□ 0.86
COX17-201ENST00000261070 TOP2BQ02880 1626 aa20.44■□□□□ 0.86
COX17-201ENST00000261070 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
COX17-201ENST00000261070 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
COX17-201ENST00000261070 GRIN2AQ12879 1464 aa20.37■□□□□ 0.85
COX17-201ENST00000261070 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.35■□□□□ 0.85
COX17-201ENST00000261070 ADAMTS12P58397 1594 aa20.34■□□□□ 0.85
COX17-201ENST00000261070 NUP160Q12769 1436 aa20.34■□□□□ 0.85
COX17-201ENST00000261070 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.32■□□□□ 0.84
COX17-201ENST00000261070 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
COX17-201ENST00000261070 SHROOM2Q13796 1616 aa20.27■□□□□ 0.83
COX17-201ENST00000261070 CEP170Q5SW79 1584 aa20.25■□□□□ 0.83
COX17-201ENST00000261070 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.12■□□□□ 0.81
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