RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474266.1

RPS6KA3-204, Transcript of ribosomal protein S6 kinase A3, humanhuman

TSL 3

Gene RPS6KA3, Length 930 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA3-204ENST00000474266 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
RPS6KA3-204ENST00000474266 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.61■■■□□ 2.33
RPS6KA3-204ENST00000474266 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.15■■■□□ 2.26
RPS6KA3-204ENST00000474266 ABCC9O60706 1549 aa26.36■■□□□ 1.81
RPS6KA3-204ENST00000474266 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.08■■□□□ 1.77
RPS6KA3-204ENST00000474266 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
RPS6KA3-204ENST00000474266 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
RPS6KA3-204ENST00000474266 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.95■■□□□ 1.58
RPS6KA3-204ENST00000474266 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.93■■□□□ 1.58
RPS6KA3-204ENST00000474266 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.76■■□□□ 1.55
RPS6KA3-204ENST00000474266 NACADO15069 1562 aa24.73■■□□□ 1.55
RPS6KA3-204ENST00000474266 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.6■■□□□ 1.53
RPS6KA3-204ENST00000474266 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.3■■□□□ 1.48
RPS6KA3-204ENST00000474266 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.28■■□□□ 1.48
RPS6KA3-204ENST00000474266 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.18■■□□□ 1.46
RPS6KA3-204ENST00000474266 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
RPS6KA3-204ENST00000474266 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.05■■□□□ 1.44
RPS6KA3-204ENST00000474266 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.99■■□□□ 1.43
RPS6KA3-204ENST00000474266 FOXD1Q16676 465 aa23.97■■□□□ 1.43
RPS6KA3-204ENST00000474266 SCRIBQ14160 1630 aa23.92■■□□□ 1.42
RPS6KA3-204ENST00000474266 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.8■■□□□ 1.4
RPS6KA3-204ENST00000474266 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.72■■□□□ 1.39
RPS6KA3-204ENST00000474266 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.71■■□□□ 1.39
RPS6KA3-204ENST00000474266 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
RPS6KA3-204ENST00000474266 ADRA2BP18089 450 aa22.98■■□□□ 1.27
RPS6KA3-204ENST00000474266 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.97■■□□□ 1.27
RPS6KA3-204ENST00000474266 NCAPD3P42695 1498 aa22.85■■□□□ 1.25
RPS6KA3-204ENST00000474266 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.81■■□□□ 1.24
RPS6KA3-204ENST00000474266 ERCC6Q03468 1493 aa22.79■■□□□ 1.24
RPS6KA3-204ENST00000474266 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.76■■□□□ 1.23
RPS6KA3-204ENST00000474266 SMARCA4P51532 1647 aa22.74■■□□□ 1.23
RPS6KA3-204ENST00000474266 SMARCA2P51531 1590 aa22.72■■□□□ 1.23
RPS6KA3-204ENST00000474266 HMGXB3Q12766 1538 aa22.65■■□□□ 1.22
RPS6KA3-204ENST00000474266 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
RPS6KA3-204ENST00000474266 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
RPS6KA3-204ENST00000474266 CUX2O14529 1486 aa22.63■■□□□ 1.21
RPS6KA3-204ENST00000474266 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
RPS6KA3-204ENST00000474266 NESP48681 1621 aa22.6■■□□□ 1.21
RPS6KA3-204ENST00000474266 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.5■■□□□ 1.19
RPS6KA3-204ENST00000474266 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.44■■□□□ 1.18
RPS6KA3-204ENST00000474266 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.33■■□□□ 1.16
RPS6KA3-204ENST00000474266 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.29■■□□□ 1.16
RPS6KA3-204ENST00000474266 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
RPS6KA3-204ENST00000474266 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.22■■□□□ 1.15
RPS6KA3-204ENST00000474266 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.21■■□□□ 1.15
RPS6KA3-204ENST00000474266 WIZO95785 1651 aa22.2■■□□□ 1.15
RPS6KA3-204ENST00000474266 MSH5O43196 834 aa22.2■■□□□ 1.14
RPS6KA3-204ENST00000474266 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.08■■□□□ 1.12
RPS6KA3-204ENST00000474266 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
RPS6KA3-204ENST00000474266 CEP164Q9UPV0 1460 aa22■■□□□ 1.11
RPS6KA3-204ENST00000474266 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.97■■□□□ 1.11
RPS6KA3-204ENST00000474266 WDR62O43379 1518 aa21.97■■□□□ 1.11
RPS6KA3-204ENST00000474266 CFTRP13569 1480 aa21.91■■□□□ 1.1
RPS6KA3-204ENST00000474266 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
RPS6KA3-204ENST00000474266 TRIM41Q8WV44 630 aa21.9■■□□□ 1.1
RPS6KA3-204ENST00000474266 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
RPS6KA3-204ENST00000474266 OSCARQ8IYS5 282 aa21.71■■□□□ 1.07
RPS6KA3-204ENST00000474266 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.71■■□□□ 1.07
RPS6KA3-204ENST00000474266 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
RPS6KA3-204ENST00000474266 PRDM2Q13029 1718 aa21.55■■□□□ 1.04
RPS6KA3-204ENST00000474266 IFT140Q96RY7 1462 aa21.54■■□□□ 1.04
RPS6KA3-204ENST00000474266 TOPBP1Q92547 1522 aa21.53■■□□□ 1.04
RPS6KA3-204ENST00000474266 ABCC8Q09428 1581 aa21.44■■□□□ 1.02
RPS6KA3-204ENST00000474266 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.41■■□□□ 1.02
RPS6KA3-204ENST00000474266 FBLN2P98095 1184 aa21.38■■□□□ 1.01
RPS6KA3-204ENST00000474266 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.38■■□□□ 1.018e-7■■■■□ 19.8
RPS6KA3-204ENST00000474266 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
RPS6KA3-204ENST00000474266 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.33■■□□□ 1
RPS6KA3-204ENST00000474266 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.33■■□□□ 1
RPS6KA3-204ENST00000474266 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.33■■□□□ 1
RPS6KA3-204ENST00000474266 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
RPS6KA3-204ENST00000474266 ARHGEF11O15085 1522 aa21.29■■□□□ 1
RPS6KA3-204ENST00000474266 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.28■■□□□ 1
RPS6KA3-204ENST00000474266 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
RPS6KA3-204ENST00000474266 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
RPS6KA3-204ENST00000474266 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.27■■□□□ 1
RPS6KA3-204ENST00000474266 SOGA1O94964 1423 aa21.26■□□□□ 0.99
RPS6KA3-204ENST00000474266 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
RPS6KA3-204ENST00000474266 CHD1O14646 1710 aa21.19■□□□□ 0.98
RPS6KA3-204ENST00000474266 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.19■□□□□ 0.98
RPS6KA3-204ENST00000474266 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa21.17■□□□□ 0.98
RPS6KA3-204ENST00000474266 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
RPS6KA3-204ENST00000474266 CUX1P39880 1505 aa21.14■□□□□ 0.97
RPS6KA3-204ENST00000474266 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.13■□□□□ 0.97
RPS6KA3-204ENST00000474266 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
RPS6KA3-204ENST00000474266 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
RPS6KA3-204ENST00000474266 ARAP1Q96P48 1450 aa21.07■□□□□ 0.96
RPS6KA3-204ENST00000474266 GRIN2BQ13224 1484 aa21.05■□□□□ 0.96
RPS6KA3-204ENST00000474266 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
RPS6KA3-204ENST00000474266 WDR97A6NE52 1622 aa21■□□□□ 0.95
RPS6KA3-204ENST00000474266 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.98■□□□□ 0.95
RPS6KA3-204ENST00000474266 SYNJ1O43426 1573 aa20.97■□□□□ 0.95
RPS6KA3-204ENST00000474266 SYNJ2O15056 1496 aa20.97■□□□□ 0.95
RPS6KA3-204ENST00000474266 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.94■□□□□ 0.94
RPS6KA3-204ENST00000474266 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.89■□□□□ 0.94
RPS6KA3-204ENST00000474266 PBRM1Q86U86 1689 aa20.88■□□□□ 0.93
RPS6KA3-204ENST00000474266 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
RPS6KA3-204ENST00000474266 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.87■□□□□ 0.93
RPS6KA3-204ENST00000474266 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.83■□□□□ 0.93
RPS6KA3-204ENST00000474266 GRIN2AQ12879 1464 aa20.76■□□□□ 0.91
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