Protein–RNA interactions for Protein: Q08J23

NSUN2, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN2Q08J23 CTC1-201ENST00000315684 7021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.861e-323■■■■■ 1506.6
NSUN2Q08J23 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.853e-8■■■■■ 1413.2
NSUN2Q08J23 LRP1B-202ENST00000434794 2621 ntTSL 213.49□□□□□ -0.251e-323■■■■■ 1280.7
NSUN2Q08J23 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.521e-323■■■■■ 1280.7
NSUN2Q08J23 ELF1-202ENST00000405737 903 ntTSL 217.49■□□□□ 0.391e-323■■■■■ 813.2
NSUN2Q08J23 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.561e-323■■■■■ 555.6
NSUN2Q08J23 RNASE11-203ENST00000413502 791 ntTSL 212.89□□□□□ -0.351e-323■■■■■ 358.2
NSUN2Q08J23 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.471e-323■■■■■ 358.2
NSUN2Q08J23 LINC01623-203ENST00000606727 1260 ntTSL 1 (best)16.03■□□□□ 0.161e-323■■■■■ 349.5
NSUN2Q08J23 LINC01623-202ENST00000606624 560 ntTSL 47.44□□□□□ -1.221e-323■■■■■ 347.8
NSUN2Q08J23 C14orf37-203ENST00000554218 572 ntTSL 48.15□□□□□ -1.11e-323■■■■■ 345
NSUN2Q08J23 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.082e-164■■■■■ 330.5
NSUN2Q08J23 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.191e-323■■■■■ 325.1
NSUN2Q08J23 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.871e-91■■■■■ 317.4
NSUN2Q08J23 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.191e-91■■■■■ 317.4
NSUN2Q08J23 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.041e-91■■■■■ 317.4
NSUN2Q08J23 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.071e-91■■■■■ 317.4
NSUN2Q08J23 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.341e-91■■■■■ 317.4
NSUN2Q08J23 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.531e-91■■■■■ 317.4
NSUN2Q08J23 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.591e-91■■■■■ 317.4
NSUN2Q08J23 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.761e-91■■■■■ 317.4
NSUN2Q08J23 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.871e-323■■■■■ 300.5
NSUN2Q08J23 FBXO31-206ENST00000569412 431 ntTSL 54.82□□□□□ -1.641e-323■■■■■ 300.5
NSUN2Q08J23 AL662890.2-201ENST00000457253 709 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.81e-323■■■■■ 277.4
NSUN2Q08J23 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC6.48□□□□□ -1.377e-32■■■■■ 275.6
NSUN2Q08J23 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.472e-12■■■■■ 273.6
NSUN2Q08J23 MIPEP-202ENST00000433710 494 ntTSL 314.83□□□□□ -0.042e-12■■■■■ 273.6
NSUN2Q08J23 MIPEP-203ENST00000464194 543 ntTSL 214.83□□□□□ -0.042e-12■■■■■ 273.6
NSUN2Q08J23 C10orf90-208ENST00000488181 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 212.39□□□□□ -0.435e-54■■■■■ 235.9
NSUN2Q08J23 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.19e-38■■■■■ 211.4
NSUN2Q08J23 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.539e-38■■■■■ 211.4
NSUN2Q08J23 LINC00472-201ENST00000413945 662 ntTSL 34.78□□□□□ -1.649e-38■■■■■ 211.4
NSUN2Q08J23 TCF3-210ENST00000587235 986 ntTSL 525.45■■□□□ 1.663e-15■■■■■ 184.8
NSUN2Q08J23 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.183e-15■■■■■ 184.8
NSUN2Q08J23 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.393e-15■■■■■ 184.8
NSUN2Q08J23 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.33e-15■■■■■ 184.8
NSUN2Q08J23 TCF3-208ENST00000586318 631 ntTSL 316.92■□□□□ 0.33e-15■■■■■ 184.8
NSUN2Q08J23 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.123e-15■■■■■ 184.8
NSUN2Q08J23 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.233e-15■■■■■ 184.8
NSUN2Q08J23 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.233e-15■■■■■ 184.8
NSUN2Q08J23 PARP4-201ENST00000381989 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.012e-40■■■■■ 170.3
NSUN2Q08J23 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.752e-34■■■■■ 146
NSUN2Q08J23 PHF20L1-202ENST00000315808 2226 ntTSL 1 (best)19.59■□□□□ 0.732e-34■■■■■ 146
NSUN2Q08J23 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.662e-34■■■■■ 146
NSUN2Q08J23 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.422e-34■■■■■ 146
NSUN2Q08J23 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.392e-34■■■■■ 146
NSUN2Q08J23 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.342e-34■■■■■ 146
NSUN2Q08J23 PHF20L1-208ENST00000395383 3229 ntTSL 515.39■□□□□ 0.062e-34■■■■■ 146
NSUN2Q08J23 PHF20L1-204ENST00000361997 3237 ntTSL 512.65□□□□□ -0.382e-34■■■■■ 146
NSUN2Q08J23 PHF20L1-206ENST00000395376 2236 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.632e-34■■■■■ 146
NSUN2Q08J23 PHF20L1-215ENST00000486199 1633 ntTSL 26.43□□□□□ -1.382e-34■■■■■ 146
NSUN2Q08J23 PHF20L1-217ENST00000521038 427 ntTSL 56.07□□□□□ -1.442e-34■■■■■ 146
NSUN2Q08J23 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.72e-34■■■■■ 146
NSUN2Q08J23 PHF20L1-212ENST00000469979 7822 ntTSL 23.13□□□□□ -1.912e-34■■■■■ 146
NSUN2Q08J23 PHF20L1-205ENST00000395374 2761 ntTSL 22.66□□□□□ -1.982e-34■■■■■ 146
NSUN2Q08J23 C2CD3-205ENST00000415191 2587 ntTSL 219.69■□□□□ 0.741e-36■■■■■ 142.5
NSUN2Q08J23 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.41e-36■■■■■ 142.5
NSUN2Q08J23 C2CD3-206ENST00000436679 1134 ntTSL 315.99■□□□□ 0.151e-36■■■■■ 142.5
NSUN2Q08J23 C2CD3-201ENST00000313663 6283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.891e-36■■■■■ 142.5
NSUN2Q08J23 C2CD3-202ENST00000334126 7960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.921e-36■■■■■ 142.5
NSUN2Q08J23 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.362e-142■■■■■ 141.9
NSUN2Q08J23 FAM238C-202ENST00000639963 1787 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.32e-142■■■■■ 141.9
NSUN2Q08J23 FAM238C-201ENST00000638416 868 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.62e-142■■■■■ 141.9
NSUN2Q08J23 FAM238C-203ENST00000640121 3620 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.672e-142■■■■■ 141.9
NSUN2Q08J23 FAM238C-205ENST00000640641 391 ntBASIC9□□□□□ -0.972e-142■■■■■ 141.9
NSUN2Q08J23 F13A1-203ENST00000431222 592 ntTSL 416.54■□□□□ 0.244e-9■■■■■ 126.5
NSUN2Q08J23 F13A1-205ENST00000451619 631 ntTSL 214.52□□□□□ -0.094e-9■■■■■ 126.5
NSUN2Q08J23 F13A1-202ENST00000414279 582 ntTSL 413.89□□□□□ -0.194e-9■■■■■ 126.5
NSUN2Q08J23 F13A1-201ENST00000264870 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.134e-9■■■■■ 126.5
NSUN2Q08J23 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.361e-33■■■■■ 124.4
NSUN2Q08J23 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.374e-8■■■■■ 123.2
NSUN2Q08J23 BTBD2-207ENST00000589685 2422 ntTSL 1 (best)18.35■□□□□ 0.534e-8■■■■■ 123.2
NSUN2Q08J23 BTBD2-202ENST00000587225 1070 ntTSL 217.17■□□□□ 0.344e-8■■■■■ 123.2
NSUN2Q08J23 BTBD2-204ENST00000587825 961 ntTSL 512.69□□□□□ -0.384e-8■■■■■ 123.2
NSUN2Q08J23 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.692e-6■■■■■ 119.4
NSUN2Q08J23 CDHR5-207ENST00000531177 2816 ntTSL 218.04■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 119.4
NSUN2Q08J23 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.132e-6■■■■■ 119.4
NSUN2Q08J23 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.252e-6■■■■■ 119.4
NSUN2Q08J23 ZNF7-205ENST00000528017 5641 ntTSL 1 (best)10.9□□□□□ -0.663e-9■■■■■ 112.8
NSUN2Q08J23 PLXDC1-215ENST00000579190 565 ntTSL 416.84■□□□□ 0.299e-12■■■■■ 111
NSUN2Q08J23 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.061e-30■■■■■ 106.9
NSUN2Q08J23 CACNA2D4-201ENST00000280663 5936 ntTSL 214.3□□□□□ -0.121e-30■■■■■ 106.9
NSUN2Q08J23 CACNA2D4-206ENST00000537784 2876 ntTSL 1 (best)12.22□□□□□ -0.451e-30■■■■■ 106.9
NSUN2Q08J23 CACNA2D4-202ENST00000382722 5475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.51e-30■■■■■ 106.9
NSUN2Q08J23 CACNA2D4-219ENST00000585708 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.561e-30■■■■■ 106.9
NSUN2Q08J23 CACNA2D4-203ENST00000444595 4450 ntTSL 1 (best)10.17□□□□□ -0.781e-30■■■■■ 106.9
NSUN2Q08J23 CACNA2D4-223ENST00000588077 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.81e-30■■■■■ 106.9
NSUN2Q08J23 CACNA2D4-222ENST00000587995 3883 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.81e-30■■■■■ 106.9
NSUN2Q08J23 CACNA2D4-221ENST00000586184 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.841e-30■■■■■ 106.9
NSUN2Q08J23 NCAM1-225ENST00000618266 5937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.391e-26■■■■■ 105.7
NSUN2Q08J23 NCAM1-220ENST00000613217 610 ntTSL 312.42□□□□□ -0.421e-26■■■■■ 105.7
NSUN2Q08J23 NCAM1-230ENST00000621850 2787 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.471e-26■■■■■ 105.7
NSUN2Q08J23 NCAM1-223ENST00000615525 729 ntTSL 511.96□□□□□ -0.491e-26■■■■■ 105.7
NSUN2Q08J23 NCAM1-210ENST00000529356 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.51e-26■■■■■ 105.7
NSUN2Q08J23 NCAM1-229ENST00000621518 4922 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.531e-26■■■■■ 105.7
NSUN2Q08J23 NCAM1-202ENST00000401611 2510 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.561e-26■■■■■ 105.7
NSUN2Q08J23 NCAM1-201ENST00000316851 5837 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.611e-26■■■■■ 105.7
NSUN2Q08J23 NCAM1-226ENST00000619839 2993 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.641e-26■■■■■ 105.7
NSUN2Q08J23 NCAM1-227ENST00000620046 585 ntTSL 410.72□□□□□ -0.691e-26■■■■■ 105.7
NSUN2Q08J23 NCAM1-221ENST00000615112 5967 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.791e-26■■■■■ 105.7
Retrieved 100 of 673 protein–RNA pairs in 336.9 ms