RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476918.1

HES1-202, Transcript of hes family bHLH transcription factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene HES1, Length 1,009 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES1-202ENST00000476918 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.64■■■■■ 5.22
HES1-202ENST00000476918 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.96■■■■■ 4.47
HES1-202ENST00000476918 ABCC9O60706 1549 aa42.87■■■■■ 4.45
HES1-202ENST00000476918 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.84■■■■■ 4.13
HES1-202ENST00000476918 NACADO15069 1562 aa40.53■■■■■ 4.08
HES1-202ENST00000476918 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.27■■■■■ 4.04
HES1-202ENST00000476918 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.13■■■■■ 4.01
HES1-202ENST00000476918 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.96■■■■□ 3.99
HES1-202ENST00000476918 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.95■■■■□ 3.99
HES1-202ENST00000476918 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.77■■■■□ 3.96
HES1-202ENST00000476918 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.72■■■■□ 3.95
HES1-202ENST00000476918 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.5■■■■□ 3.91
HES1-202ENST00000476918 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.4■■■■□ 3.9
HES1-202ENST00000476918 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.15■■■■□ 3.86
HES1-202ENST00000476918 SCRIBQ14160 1630 aa39.02■■■■□ 3.84
HES1-202ENST00000476918 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.82■■■■□ 3.81
HES1-202ENST00000476918 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.7■■■■□ 3.79
HES1-202ENST00000476918 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.64■■■■□ 3.78
HES1-202ENST00000476918 NCAPD3P42695 1498 aa37.36■■■■□ 3.57
HES1-202ENST00000476918 SMARCA4P51532 1647 aa37.25■■■■□ 3.55
HES1-202ENST00000476918 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.24■■■■□ 3.55
HES1-202ENST00000476918 HMGXB3Q12766 1538 aa37.17■■■■□ 3.54
HES1-202ENST00000476918 SMARCA2P51531 1590 aa37.17■■■■□ 3.54
HES1-202ENST00000476918 CUX2O14529 1486 aa37.07■■■■□ 3.52
HES1-202ENST00000476918 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.05■■■■□ 3.52
HES1-202ENST00000476918 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37■■■■□ 3.51
HES1-202ENST00000476918 ERCC6Q03468 1493 aa37■■■■□ 3.51
HES1-202ENST00000476918 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.92■■■■□ 3.5
HES1-202ENST00000476918 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.86■■■■□ 3.49
HES1-202ENST00000476918 NESP48681 1621 aa36.83■■■■□ 3.49
HES1-202ENST00000476918 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.71■■■■□ 3.47
HES1-202ENST00000476918 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.61■■■■□ 3.45
HES1-202ENST00000476918 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.61■■■■□ 3.45
HES1-202ENST00000476918 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.5■■■■□ 3.43
HES1-202ENST00000476918 WIZO95785 1651 aa36.32■■■■□ 3.4
HES1-202ENST00000476918 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.28■■■■□ 3.4
HES1-202ENST00000476918 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.16■■■■□ 3.38
HES1-202ENST00000476918 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.05■■■■□ 3.36
HES1-202ENST00000476918 WDR62O43379 1518 aa36.03■■■■□ 3.36
HES1-202ENST00000476918 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.86■■■■□ 3.33
HES1-202ENST00000476918 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.84■■■■□ 3.33
HES1-202ENST00000476918 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.83■■■■□ 3.33
HES1-202ENST00000476918 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.8■■■■□ 3.32
HES1-202ENST00000476918 CFTRP13569 1480 aa35.8■■■■□ 3.32
HES1-202ENST00000476918 PRDM2Q13029 1718 aa35.69■■■■□ 3.3
HES1-202ENST00000476918 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.56■■■■□ 3.28
HES1-202ENST00000476918 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.34■■■■□ 3.25
HES1-202ENST00000476918 TRIM41Q8WV44 630 aa35.3■■■■□ 3.24
HES1-202ENST00000476918 OSCARQ8IYS5 282 aa35.16■■■■□ 3.22
HES1-202ENST00000476918 TOPBP1Q92547 1522 aa35.15■■■■□ 3.22
HES1-202ENST00000476918 IFT140Q96RY7 1462 aa35.14■■■■□ 3.22
HES1-202ENST00000476918 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.11■■■■□ 3.21
HES1-202ENST00000476918 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.04■■■■□ 3.2
HES1-202ENST00000476918 ABCC8Q09428 1581 aa35.02■■■■□ 3.2
HES1-202ENST00000476918 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.01■■■■□ 3.2
HES1-202ENST00000476918 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.96■■■■□ 3.19
HES1-202ENST00000476918 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.96■■■■□ 3.19
HES1-202ENST00000476918 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.96■■■■□ 3.19
HES1-202ENST00000476918 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.92■■■■□ 3.18
HES1-202ENST00000476918 CHD1O14646 1710 aa34.84■■■■□ 3.17
HES1-202ENST00000476918 ARHGEF11O15085 1522 aa34.79■■■■□ 3.16
HES1-202ENST00000476918 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.78■■■■□ 3.16
HES1-202ENST00000476918 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.72■■■■□ 3.154e-7■■■■■ 39.2
HES1-202ENST00000476918 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.59■■■■□ 3.13
HES1-202ENST00000476918 WDR97A6NE52 1622 aa34.57■■■■□ 3.12
HES1-202ENST00000476918 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.52■■■■□ 3.12
HES1-202ENST00000476918 SOGA1O94964 1423 aa34.52■■■■□ 3.12
HES1-202ENST00000476918 CUX1P39880 1505 aa34.51■■■■□ 3.12
HES1-202ENST00000476918 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.45■■■■□ 3.11
HES1-202ENST00000476918 ARAP1Q96P48 1450 aa34.44■■■■□ 3.1
HES1-202ENST00000476918 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.42■■■■□ 3.1
HES1-202ENST00000476918 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.37■■■■□ 3.09
HES1-202ENST00000476918 FBLN2P98095 1184 aa34.37■■■■□ 3.09
HES1-202ENST00000476918 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.34■■■■□ 3.09
HES1-202ENST00000476918 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.34■■■■□ 3.09
HES1-202ENST00000476918 PBRM1Q86U86 1689 aa34.33■■■■□ 3.09
HES1-202ENST00000476918 GRIN2BQ13224 1484 aa34.29■■■■□ 3.08
HES1-202ENST00000476918 SYNJ1O43426 1573 aa34.28■■■■□ 3.08
HES1-202ENST00000476918 SYNJ2O15056 1496 aa34.21■■■■□ 3.07
HES1-202ENST00000476918 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.2■■■■□ 3.07
HES1-202ENST00000476918 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.15■■■■□ 3.06
HES1-202ENST00000476918 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.14■■■■□ 3.06
HES1-202ENST00000476918 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.13■■■■□ 3.05
HES1-202ENST00000476918 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.01■■■■□ 3.04
HES1-202ENST00000476918 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
HES1-202ENST00000476918 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.96■■■■□ 3.03
HES1-202ENST00000476918 TOP2BQ02880 1626 aa33.96■■■■□ 3.03
HES1-202ENST00000476918 ADAMTS12P58397 1594 aa33.94■■■■□ 3.02
HES1-202ENST00000476918 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.9■■■■□ 3.02
HES1-202ENST00000476918 GRIN2AQ12879 1464 aa33.88■■■■□ 3.01
HES1-202ENST00000476918 CEP170Q5SW79 1584 aa33.83■■■■□ 3.01
HES1-202ENST00000476918 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.79■■■■□ 3
HES1-202ENST00000476918 NUP160Q12769 1436 aa33.79■■■■□ 3
HES1-202ENST00000476918 SHROOM2Q13796 1616 aa33.75■■■□□ 2.99
HES1-202ENST00000476918 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.74■■■□□ 2.99
HES1-202ENST00000476918 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.7■■■□□ 2.98
HES1-202ENST00000476918 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.48■■■□□ 2.95
HES1-202ENST00000476918 KIF13AQ9H1H9 1805 aa33.42■■■□□ 2.94
HES1-202ENST00000476918 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.38■■■□□ 2.93
HES1-202ENST00000476918 JPH4Q96JJ6 628 aa33.28■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms