RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000232424.3

HES1-201, Transcript of hes family bHLH transcription factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HES1, Length 1,578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES1-201ENST00000232424 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.3■■■■■ 4.36
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HES1-201ENST00000232424 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.11■■■■□ 3.21
HES1-201ENST00000232424 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.02■■■■□ 3.2
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HES1-201ENST00000232424 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.95■■■□□ 2.86
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HES1-201ENST00000232424 SMARCA4P51532 1647 aa32.72■■■□□ 2.83
HES1-201ENST00000232424 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.63■■■□□ 2.81
HES1-201ENST00000232424 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.54■■■□□ 2.8
HES1-201ENST00000232424 NCAPD3P42695 1498 aa32.48■■■□□ 2.79
HES1-201ENST00000232424 SMARCA2P51531 1590 aa32.45■■■□□ 2.79
HES1-201ENST00000232424 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.41■■■□□ 2.78
HES1-201ENST00000232424 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.37■■■□□ 2.77
HES1-201ENST00000232424 HMGXB3Q12766 1538 aa32.28■■■□□ 2.76
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HES1-201ENST00000232424 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.25■■■□□ 2.75
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HES1-201ENST00000232424 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.59■■■□□ 2.65
HES1-201ENST00000232424 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.56■■■□□ 2.64
HES1-201ENST00000232424 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.51■■■□□ 2.64
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HES1-201ENST00000232424 ERCC6Q03468 1493 aa31.36■■■□□ 2.61
HES1-201ENST00000232424 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.34■■■□□ 2.61
HES1-201ENST00000232424 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.18■■■□□ 2.58
HES1-201ENST00000232424 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.17■■■□□ 2.58
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HES1-201ENST00000232424 MRC2Q9UBG0 1479 aa31■■■□□ 2.55
HES1-201ENST00000232424 CUX2O14529 1486 aa30.92■■■□□ 2.54
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HES1-201ENST00000232424 TOPBP1Q92547 1522 aa30.7■■■□□ 2.51
HES1-201ENST00000232424 ABCC8Q09428 1581 aa30.67■■■□□ 2.5
HES1-201ENST00000232424 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.65■■■□□ 2.5
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HES1-201ENST00000232424 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.48■■■□□ 2.47
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HES1-201ENST00000232424 IFT140Q96RY7 1462 aa30.43■■■□□ 2.46
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HES1-201ENST00000232424 SOGA1O94964 1423 aa30.37■■■□□ 2.45
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HES1-201ENST00000232424 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
HES1-201ENST00000232424 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.33■■■□□ 2.45
HES1-201ENST00000232424 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.31■■■□□ 2.44
HES1-201ENST00000232424 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.2■■■□□ 2.434e-7■■■■■ 39.2
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HES1-201ENST00000232424 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.14■■■□□ 2.42
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HES1-201ENST00000232424 WDR97A6NE52 1622 aa30.08■■■□□ 2.41
HES1-201ENST00000232424 GAPVD1Q14C86 1478 aa30■■■□□ 2.39
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HES1-201ENST00000232424 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.96■■■□□ 2.39
HES1-201ENST00000232424 GRIN2BQ13224 1484 aa29.95■■■□□ 2.38
HES1-201ENST00000232424 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.89■■■□□ 2.37
HES1-201ENST00000232424 PBRM1Q86U86 1689 aa29.82■■■□□ 2.36
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HES1-201ENST00000232424 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.81■■■□□ 2.36
HES1-201ENST00000232424 KIF27Q86VH2 1401 aa29.81■■■□□ 2.36
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HES1-201ENST00000232424 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.76■■■□□ 2.35
HES1-201ENST00000232424 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
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HES1-201ENST00000232424 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.4■■■□□ 2.3
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HES1-201ENST00000232424 PRXQ9BXM0 1461 aa29.33■■■□□ 2.29
HES1-201ENST00000232424 ARHGEF11O15085 1522 aa29.24■■■□□ 2.27
HES1-201ENST00000232424 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.22■■■□□ 2.27
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