Protein–RNA interactions for Protein: U3KQA8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQA8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
U3KQA8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
U3KQA8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
U3KQA8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
U3KQA8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
U3KQA8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
U3KQA8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
U3KQA8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
U3KQA8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
U3KQA8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
U3KQA8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
U3KQA8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
U3KQA8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
U3KQA8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
U3KQA8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
U3KQA8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
U3KQA8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
U3KQA8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
U3KQA8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
U3KQA8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
U3KQA8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
U3KQA8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
U3KQA8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
U3KQA8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
U3KQA8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
U3KQA8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
U3KQA8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
U3KQA8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
U3KQA8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
U3KQA8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
U3KQA8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
U3KQA8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
U3KQA8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
U3KQA8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
U3KQA8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
U3KQA8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
U3KQA8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
U3KQA8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
U3KQA8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U3KQA8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U3KQA8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U3KQA8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
U3KQA8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
U3KQA8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U3KQA8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
U3KQA8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
U3KQA8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U3KQA8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
U3KQA8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
U3KQA8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
U3KQA8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
U3KQA8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
U3KQA8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
U3KQA8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
U3KQA8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
U3KQA8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
U3KQA8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
U3KQA8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
U3KQA8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
U3KQA8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
U3KQA8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
U3KQA8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
U3KQA8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
U3KQA8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
U3KQA8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
U3KQA8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
U3KQA8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
U3KQA8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
U3KQA8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
U3KQA8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
U3KQA8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
U3KQA8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
U3KQA8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
U3KQA8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
U3KQA8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
U3KQA8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
U3KQA8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
U3KQA8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
U3KQA8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
U3KQA8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
U3KQA8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
U3KQA8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
U3KQA8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
U3KQA8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
U3KQA8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
U3KQA8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
U3KQA8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
U3KQA8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
U3KQA8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
U3KQA8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
U3KQA8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
U3KQA8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
U3KQA8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
U3KQA8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
U3KQA8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
U3KQA8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
U3KQA8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
U3KQA8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
U3KQA8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
U3KQA8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms