Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CAPN6Q9Y6Q1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAPN6Q9Y6Q1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAPN6Q9Y6Q1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAPN6Q9Y6Q1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CAPN6Q9Y6Q1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAPN6Q9Y6Q1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAPN6Q9Y6Q1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAPN6Q9Y6Q1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAPN6Q9Y6Q1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPN6Q9Y6Q1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPN6Q9Y6Q1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPN6Q9Y6Q1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPN6Q9Y6Q1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPN6Q9Y6Q1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAPN6Q9Y6Q1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAPN6Q9Y6Q1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAPN6Q9Y6Q1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAPN6Q9Y6Q1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAPN6Q9Y6Q1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CAPN6Q9Y6Q1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CAPN6Q9Y6Q1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CAPN6Q9Y6Q1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CAPN6Q9Y6Q1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAPN6Q9Y6Q1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CAPN6Q9Y6Q1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAPN6Q9Y6Q1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAPN6Q9Y6Q1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAPN6Q9Y6Q1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAPN6Q9Y6Q1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAPN6Q9Y6Q1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAPN6Q9Y6Q1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAPN6Q9Y6Q1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAPN6Q9Y6Q1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAPN6Q9Y6Q1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAPN6Q9Y6Q1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPN6Q9Y6Q1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPN6Q9Y6Q1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPN6Q9Y6Q1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPN6Q9Y6Q1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAPN6Q9Y6Q1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAPN6Q9Y6Q1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAPN6Q9Y6Q1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAPN6Q9Y6Q1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAPN6Q9Y6Q1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPN6Q9Y6Q1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPN6Q9Y6Q1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPN6Q9Y6Q1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPN6Q9Y6Q1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPN6Q9Y6Q1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPN6Q9Y6Q1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPN6Q9Y6Q1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPN6Q9Y6Q1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPN6Q9Y6Q1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPN6Q9Y6Q1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPN6Q9Y6Q1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPN6Q9Y6Q1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPN6Q9Y6Q1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPN6Q9Y6Q1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAPN6Q9Y6Q1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAPN6Q9Y6Q1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAPN6Q9Y6Q1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAPN6Q9Y6Q1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAPN6Q9Y6Q1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAPN6Q9Y6Q1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPN6Q9Y6Q1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPN6Q9Y6Q1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPN6Q9Y6Q1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPN6Q9Y6Q1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAPN6Q9Y6Q1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAPN6Q9Y6Q1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAPN6Q9Y6Q1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAPN6Q9Y6Q1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CAPN6Q9Y6Q1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAPN6Q9Y6Q1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAPN6Q9Y6Q1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAPN6Q9Y6Q1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAPN6Q9Y6Q1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CAPN6Q9Y6Q1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAPN6Q9Y6Q1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAPN6Q9Y6Q1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAPN6Q9Y6Q1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAPN6Q9Y6Q1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPN6Q9Y6Q1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPN6Q9Y6Q1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPN6Q9Y6Q1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPN6Q9Y6Q1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPN6Q9Y6Q1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPN6Q9Y6Q1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPN6Q9Y6Q1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPN6Q9Y6Q1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPN6Q9Y6Q1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPN6Q9Y6Q1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPN6Q9Y6Q1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPN6Q9Y6Q1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPN6Q9Y6Q1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPN6Q9Y6Q1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
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