Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J1

UTP18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP18Q9Y5J1 RPS13-201ENST00000228140 491 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.656e-17■■■□□ 18.3
UTP18Q9Y5J1 RPS13-202ENST00000525634 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.886e-17■■■□□ 18.3
UTP18Q9Y5J1 RPS13-208ENST00000531908 746 ntTSL 26.19□□□□□ -1.426e-17■■■□□ 18.3
UTP18Q9Y5J1 PKP4-209ENST00000479398 550 ntTSL 521.96■■□□□ 1.111e-6■■■□□ 18.3
UTP18Q9Y5J1 PKP4-205ENST00000426248 4134 ntTSL 1 (best)17.09■□□□□ 0.331e-6■■■□□ 18.3
UTP18Q9Y5J1 PKP4-206ENST00000452162 2359 ntTSL 1 (best)11.75□□□□□ -0.531e-6■■■□□ 18.3
UTP18Q9Y5J1 PKP4-201ENST00000389757 5777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.581e-6■■■□□ 18.3
UTP18Q9Y5J1 PKP4-203ENST00000411900 552 ntTSL 410.52□□□□□ -0.731e-6■■■□□ 18.3
UTP18Q9Y5J1 PKP4-202ENST00000389759 4443 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.871e-6■■■□□ 18.3
UTP18Q9Y5J1 PKP4-207ENST00000457109 520 ntTSL 39.17□□□□□ -0.941e-6■■■□□ 18.3
UTP18Q9Y5J1 PKP4-217ENST00000628904 3856 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.071e-6■■■□□ 18.3
UTP18Q9Y5J1 OAZ1-203ENST00000586054 2832 nt23.37■■□□□ 1.332e-6■■■□□ 18.3
UTP18Q9Y5J1 OAZ1-204ENST00000588673 780 ntTSL 321.7■■□□□ 1.062e-6■■■□□ 18.3
UTP18Q9Y5J1 SLC6A8-203ENST00000429147 334 ntTSL 217.7■□□□□ 0.421e-9■■■□□ 18.2
UTP18Q9Y5J1 SLC6A8-208ENST00000467402 308 ntTSL 512.31□□□□□ -0.441e-9■■■□□ 18.2
UTP18Q9Y5J1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.653e-7■■■□□ 18.1
UTP18Q9Y5J1 FANCA-222ENST00000567205 413 ntTSL 1 (best)17.45■□□□□ 0.383e-7■■■□□ 18.1
UTP18Q9Y5J1 ATAD3B-203ENST00000472194 4314 ntTSL 1 (best)13.33□□□□□ -0.283e-7■■■□□ 18.1
UTP18Q9Y5J1 FANCA-207ENST00000561667 528 ntTSL 411.99□□□□□ -0.493e-7■■■□□ 18.1
UTP18Q9Y5J1 NASP-202ENST00000351223 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.664e-6■■■□□ 18.1
UTP18Q9Y5J1 NASP-224ENST00000537798 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.934e-6■■■□□ 18.1
UTP18Q9Y5J1 NASP-201ENST00000350030 3207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.944e-6■■■□□ 18.1
UTP18Q9Y5J1 NASP-221ENST00000531612 938 ntAPPRIS ALT2 TSL 59.07□□□□□ -0.964e-6■■■□□ 18.1
UTP18Q9Y5J1 NASP-203ENST00000372052 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.034e-6■■■□□ 18.1
UTP18Q9Y5J1 NASP-218ENST00000530073 2740 ntTSL 28.59□□□□□ -1.034e-6■■■□□ 18.1
UTP18Q9Y5J1 NASP-223ENST00000534450 632 ntTSL 28.15□□□□□ -1.14e-6■■■□□ 18.1
UTP18Q9Y5J1 NASP-210ENST00000481782 3659 ntTSL 28.13□□□□□ -1.114e-6■■■□□ 18.1
UTP18Q9Y5J1 SREBF1-206ENST00000423161 1058 ntTSL 319.22■□□□□ 0.677e-7■■■□□ 17.9
UTP18Q9Y5J1 SREBF1-203ENST00000395751 4653 ntTSL 218.77■□□□□ 0.67e-7■■■□□ 17.9
UTP18Q9Y5J1 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.477e-7■■■□□ 17.9
UTP18Q9Y5J1 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.157e-7■■■□□ 17.9
UTP18Q9Y5J1 SREBF1-222ENST00000583732 580 ntTSL 415.65■□□□□ 0.17e-7■■■□□ 17.9
UTP18Q9Y5J1 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.077e-7■■■□□ 17.9
UTP18Q9Y5J1 SREBF1-217ENST00000577897 536 ntTSL 415.18■□□□□ 0.027e-7■■■□□ 17.9
UTP18Q9Y5J1 SREBF1-209ENST00000470247 374 ntTSL 512.21□□□□□ -0.457e-7■■■□□ 17.9
UTP18Q9Y5J1 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.123e-6■■■□□ 17.9
UTP18Q9Y5J1 FASN-208ENST00000635733 100 ntTSL 59.19□□□□□ -0.944e-9■■■□□ 17.9
UTP18Q9Y5J1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.871e-6■■■□□ 17.8
UTP18Q9Y5J1 OAZ1-210ENST00000593012 1357 ntTSL 220.14■□□□□ 0.811e-6■■■□□ 17.8
UTP18Q9Y5J1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.651e-6■■■□□ 17.8
UTP18Q9Y5J1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.51e-6■■■□□ 17.8
UTP18Q9Y5J1 OAZ1-201ENST00000581150 1131 ntTSL 518.15■□□□□ 0.51e-6■■■□□ 17.8
UTP18Q9Y5J1 OAZ1-209ENST00000592787 857 ntTSL 217.32■□□□□ 0.361e-6■■■□□ 17.8
UTP18Q9Y5J1 OAZ1-207ENST00000590943 1012 ntTSL 217.25■□□□□ 0.351e-6■■■□□ 17.8
UTP18Q9Y5J1 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.98□□□□□ -2.098e-12■■■□□ 17.8
UTP18Q9Y5J1 SNHG16-208ENST00000591956 556 ntTSL 212.14□□□□□ -0.475e-8■■■□□ 17.8
UTP18Q9Y5J1 SNHG16-204ENST00000586942 568 ntTSL 4 BASIC11.1□□□□□ -0.635e-8■■■□□ 17.8
UTP18Q9Y5J1 SNHG16-201ENST00000448136 3607 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.675e-8■■■□□ 17.8
UTP18Q9Y5J1 SNHG16-207ENST00000590435 1947 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.725e-8■■■□□ 17.8
UTP18Q9Y5J1 SNHG16-202ENST00000493536 2424 ntTSL 1 (best)9.68□□□□□ -0.865e-8■■■□□ 17.8
UTP18Q9Y5J1 SNHG16-206ENST00000587838 884 ntTSL 34.08□□□□□ -1.765e-8■■■□□ 17.8
UTP18Q9Y5J1 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.65□□□□□ -2.155e-8■■■□□ 17.7
UTP18Q9Y5J1 HSP90AA1-204ENST00000554401 1710 ntTSL 1 (best)9.36□□□□□ -0.915e-26■■■□□ 17.4
UTP18Q9Y5J1 PUM1-202ENST00000373741 4242 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.382e-9■■■□□ 17.4
UTP18Q9Y5J1 PUM1-201ENST00000257075 5360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.522e-9■■■□□ 17.4
UTP18Q9Y5J1 PUM1-208ENST00000471894 812 ntTSL 311.47□□□□□ -0.572e-9■■■□□ 17.4
UTP18Q9Y5J1 PUM1-210ENST00000490546 707 ntTSL 411.25□□□□□ -0.612e-9■■■□□ 17.4
UTP18Q9Y5J1 PUM1-203ENST00000373742 3515 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.852e-9■■■□□ 17.4
UTP18Q9Y5J1 PUM1-204ENST00000373747 5375 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.922e-9■■■□□ 17.4
UTP18Q9Y5J1 PUM1-205ENST00000424085 4631 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.012e-9■■■□□ 17.4
UTP18Q9Y5J1 PUM1-223ENST00000532678 793 ntTSL 48.58□□□□□ -1.042e-9■■■□□ 17.4
UTP18Q9Y5J1 PUM1-214ENST00000525843 4528 ntTSL 58.18□□□□□ -1.12e-9■■■□□ 17.4
UTP18Q9Y5J1 PUM1-211ENST00000498419 3068 ntTSL 57.43□□□□□ -1.222e-9■■■□□ 17.4
UTP18Q9Y5J1 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.262e-9■■■□□ 17.4
UTP18Q9Y5J1 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.332e-9■■■□□ 17.4
UTP18Q9Y5J1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.761e-7■■■□□ 17.2
UTP18Q9Y5J1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.921e-7■■■□□ 17.2
UTP18Q9Y5J1 LMO2-205ENST00000465614 869 ntTSL 524.89■■□□□ 1.581e-7■■■□□ 17.2
UTP18Q9Y5J1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.381e-7■■■□□ 17.2
UTP18Q9Y5J1 LMO2-203ENST00000411482 1519 ntTSL 1 (best)21.2■□□□□ 0.981e-7■■■□□ 17.2
UTP18Q9Y5J1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.861e-7■■■□□ 17.2
UTP18Q9Y5J1 LMO2-206ENST00000493667 390 ntTSL 319.64■□□□□ 0.731e-7■■■□□ 17.2
UTP18Q9Y5J1 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.41e-7■■■□□ 17.2
UTP18Q9Y5J1 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.41e-7■■■□□ 17.2
UTP18Q9Y5J1 C16orf58-210ENST00000568491 2422 ntTSL 216.23■□□□□ 0.191e-7■■■□□ 17.2
UTP18Q9Y5J1 PPP1R12C-203ENST00000586197 472 ntTSL 515.79■□□□□ 0.121e-7■■■□□ 17.2
UTP18Q9Y5J1 C16orf58-208ENST00000567673 766 ntTSL 212.34□□□□□ -0.431e-7■■■□□ 17.2
UTP18Q9Y5J1 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.241e-7■■■□□ 17.2
UTP18Q9Y5J1 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.631e-7■■■□□ 17.2
UTP18Q9Y5J1 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.15e-6■■■□□ 17.2
UTP18Q9Y5J1 CBFA2T3-210ENST00000569464 1327 ntTSL 1 (best)14.66□□□□□ -0.065e-6■■■□□ 17.2
UTP18Q9Y5J1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.955e-7■■■□□ 17.1
UTP18Q9Y5J1 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.375e-7■■■□□ 17.1
UTP18Q9Y5J1 RREB1-206ENST00000471433 1021 ntTSL 513.76□□□□□ -0.215e-7■■■□□ 17.1
UTP18Q9Y5J1 RREB1-209ENST00000491191 998 ntTSL 513.03□□□□□ -0.325e-7■■■□□ 17.1
UTP18Q9Y5J1 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.213e-8■■■□□ 17.1
UTP18Q9Y5J1 SNORD91A-202ENST00000609620 191 ntBASIC8.3□□□□□ -1.082e-27■■■□□ 17.1
UTP18Q9Y5J1 SNORD91A-201ENST00000390861 95 nt1.61□□□□□ -2.152e-27■■■□□ 17.1
UTP18Q9Y5J1 UBR4-205ENST00000417040 6175 ntTSL 513.38□□□□□ -0.273e-6■■■□□ 17.1
UTP18Q9Y5J1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.632e-53■■■□□ 16.7
UTP18Q9Y5J1 RPS12-202ENST00000484616 639 ntTSL 23.38□□□□□ -1.872e-53■■■□□ 16.7
UTP18Q9Y5J1 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.72□□□□□ -2.292e-53■■■□□ 16.7
UTP18Q9Y5J1 RPS13-209ENST00000533969 355 ntTSL 314.38□□□□□ -0.118e-46■■■□□ 16.7
UTP18Q9Y5J1 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC3.41□□□□□ -1.868e-46■■■□□ 16.7
UTP18Q9Y5J1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.021e-6■■■□□ 16.6
UTP18Q9Y5J1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.931e-6■■■□□ 16.6
UTP18Q9Y5J1 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.731e-6■■■□□ 16.6
UTP18Q9Y5J1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.621e-6■■■□□ 16.6
UTP18Q9Y5J1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.611e-6■■■□□ 16.6
UTP18Q9Y5J1 SLC3A2-213ENST00000539458 565 ntTSL 518.62■□□□□ 0.571e-6■■■□□ 16.6
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