RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465614.1

LMO2-205, Transcript of LIM domain only 2, humanhuman

TSL 5

Gene LMO2, Length 869 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2-205ENST00000465614 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.15■■■■■ 7.22
LMO2-205ENST00000465614 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.87■■■■■ 6.21
LMO2-205ENST00000465614 ABCC9O60706 1549 aa53.79■■■■■ 6.2
LMO2-205ENST00000465614 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.25■■■■■ 5.79
LMO2-205ENST00000465614 NACADO15069 1562 aa50.97■■■■■ 5.75
LMO2-205ENST00000465614 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.66■■■■■ 5.7
LMO2-205ENST00000465614 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.44■■■■■ 5.67
LMO2-205ENST00000465614 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.36■■■■■ 5.65
LMO2-205ENST00000465614 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.12■■■■■ 5.61
LMO2-205ENST00000465614 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.99■■■■■ 5.59
LMO2-205ENST00000465614 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.88■■■■■ 5.57
LMO2-205ENST00000465614 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.78■■■■■ 5.56
LMO2-205ENST00000465614 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.73■■■■■ 5.55
LMO2-205ENST00000465614 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.18■■■■■ 5.46
LMO2-205ENST00000465614 SCRIBQ14160 1630 aa49.06■■■■■ 5.44
LMO2-205ENST00000465614 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.59■■■■■ 5.37
LMO2-205ENST00000465614 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.54■■■■■ 5.36
LMO2-205ENST00000465614 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.48■■■■■ 5.35
LMO2-205ENST00000465614 NCAPD3P42695 1498 aa47.09■■■■■ 5.13
LMO2-205ENST00000465614 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.94■■■■■ 5.1
LMO2-205ENST00000465614 SMARCA4P51532 1647 aa46.86■■■■■ 5.09
LMO2-205ENST00000465614 SMARCA2P51531 1590 aa46.78■■■■■ 5.08
LMO2-205ENST00000465614 HMGXB3Q12766 1538 aa46.71■■■■■ 5.07
LMO2-205ENST00000465614 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.67■■■■■ 5.06
LMO2-205ENST00000465614 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.46■■■■■ 5.03
LMO2-205ENST00000465614 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.45■■■■■ 5.03
LMO2-205ENST00000465614 ERCC6Q03468 1493 aa46.44■■■■■ 5.02
LMO2-205ENST00000465614 CUX2O14529 1486 aa46.38■■■■■ 5.01
LMO2-205ENST00000465614 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.33■■■■■ 5.01
LMO2-205ENST00000465614 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.27■■■■■ 5
LMO2-205ENST00000465614 NESP48681 1621 aa46.24■■■■■ 4.99
LMO2-205ENST00000465614 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.96■■■■■ 4.95
LMO2-205ENST00000465614 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.75■■■■■ 4.91
LMO2-205ENST00000465614 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.72■■■■■ 4.91
LMO2-205ENST00000465614 WIZO95785 1651 aa45.72■■■■■ 4.91
LMO2-205ENST00000465614 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.66■■■■■ 4.9
LMO2-205ENST00000465614 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.58■■■■■ 4.89
LMO2-205ENST00000465614 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.44■■■■■ 4.87
LMO2-205ENST00000465614 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.29■■■■■ 4.84
LMO2-205ENST00000465614 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.21■■■■■ 4.83
LMO2-205ENST00000465614 WDR62O43379 1518 aa45.19■■■■■ 4.82
LMO2-205ENST00000465614 CFTRP13569 1480 aa45.16■■■■■ 4.82
LMO2-205ENST00000465614 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.12■■■■■ 4.81
LMO2-205ENST00000465614 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.1■■■■■ 4.81
LMO2-205ENST00000465614 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.72■■■■■ 4.75
LMO2-205ENST00000465614 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.71■■■■■ 4.75
LMO2-205ENST00000465614 PRDM2Q13029 1718 aa44.55■■■■■ 4.72
LMO2-205ENST00000465614 OSCARQ8IYS5 282 aa44.28■■■■■ 4.68
LMO2-205ENST00000465614 TOPBP1Q92547 1522 aa44.25■■■■■ 4.67
LMO2-205ENST00000465614 IFT140Q96RY7 1462 aa44.25■■■■■ 4.67
LMO2-205ENST00000465614 ABCC8Q09428 1581 aa44.19■■■■■ 4.66
LMO2-205ENST00000465614 TRIM41Q8WV44 630 aa44.19■■■■■ 4.66
LMO2-205ENST00000465614 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.14■■■■■ 4.66
LMO2-205ENST00000465614 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.09■■■■■ 4.65
LMO2-205ENST00000465614 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.87■■■■■ 4.61
LMO2-205ENST00000465614 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.84■■■■■ 4.61
LMO2-205ENST00000465614 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.82■■■■■ 4.6
LMO2-205ENST00000465614 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.76■■■■■ 4.68e-8■■■□□ 18.2
LMO2-205ENST00000465614 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.64■■■■■ 4.58
LMO2-205ENST00000465614 SOGA1O94964 1423 aa43.62■■■■■ 4.57
LMO2-205ENST00000465614 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.61■■■■■ 4.57
LMO2-205ENST00000465614 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.61■■■■■ 4.57
LMO2-205ENST00000465614 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.61■■■■■ 4.57
LMO2-205ENST00000465614 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.54■■■■■ 4.56
LMO2-205ENST00000465614 ARHGEF11O15085 1522 aa43.53■■■■■ 4.56
LMO2-205ENST00000465614 CUX1P39880 1505 aa43.53■■■■■ 4.56
LMO2-205ENST00000465614 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.52■■■■■ 4.56
LMO2-205ENST00000465614 CHD1O14646 1710 aa43.46■■■■■ 4.55
LMO2-205ENST00000465614 WDR97A6NE52 1622 aa43.42■■■■■ 4.54
LMO2-205ENST00000465614 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.42■■■■■ 4.54
LMO2-205ENST00000465614 FBLN2P98095 1184 aa43.42■■■■■ 4.54
LMO2-205ENST00000465614 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.31■■■■■ 4.52
LMO2-205ENST00000465614 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.24■■■■■ 4.51
LMO2-205ENST00000465614 GRIN2BQ13224 1484 aa43.23■■■■■ 4.51
LMO2-205ENST00000465614 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.21■■■■■ 4.51
LMO2-205ENST00000465614 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.16■■■■■ 4.5
LMO2-205ENST00000465614 ARAP1Q96P48 1450 aa43.13■■■■■ 4.49
LMO2-205ENST00000465614 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.09■■■■■ 4.49
LMO2-205ENST00000465614 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.08■■■■■ 4.49
LMO2-205ENST00000465614 SYNJ2O15056 1496 aa43.08■■■■■ 4.49
LMO2-205ENST00000465614 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.07■■■■■ 4.49
LMO2-205ENST00000465614 SYNJ1O43426 1573 aa43.03■■■■■ 4.48
LMO2-205ENST00000465614 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.97■■■■■ 4.47
LMO2-205ENST00000465614 PBRM1Q86U86 1689 aa42.95■■■■■ 4.47
LMO2-205ENST00000465614 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.93■■■■■ 4.461e-7■■■□□ 15.3
LMO2-205ENST00000465614 TOP2BQ02880 1626 aa42.83■■■■■ 4.45
LMO2-205ENST00000465614 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.81■■■■■ 4.44
LMO2-205ENST00000465614 GRIN2AQ12879 1464 aa42.68■■■■■ 4.42
LMO2-205ENST00000465614 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.67■■■■■ 4.42
LMO2-205ENST00000465614 ADAMTS12P58397 1594 aa42.63■■■■■ 4.41
LMO2-205ENST00000465614 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.56■■■■■ 4.4
LMO2-205ENST00000465614 NUP160Q12769 1436 aa42.56■■■■■ 4.4
LMO2-205ENST00000465614 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.53■■■■■ 4.4
LMO2-205ENST00000465614 CEP170Q5SW79 1584 aa42.48■■■■■ 4.39
LMO2-205ENST00000465614 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.38■■■■■ 4.37
LMO2-205ENST00000465614 SHROOM2Q13796 1616 aa42.31■■■■■ 4.36
LMO2-205ENST00000465614 JPH4Q96JJ6 628 aa42.12■■■■■ 4.33
LMO2-205ENST00000465614 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.11■■■■■ 4.33
LMO2-205ENST00000465614 IGF1RP08069 1367 aa42.05■■■■■ 4.32
LMO2-205ENST00000465614 KIF27Q86VH2 1401 aa42.04■■■■■ 4.32
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