Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5H0

PCDHGA3, Protocadherin gamma-A3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGA3Q9Y5H0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHGA3Q9Y5H0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHGA3Q9Y5H0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHGA3Q9Y5H0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHGA3Q9Y5H0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHGA3Q9Y5H0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHGA3Q9Y5H0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHGA3Q9Y5H0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHGA3Q9Y5H0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHGA3Q9Y5H0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHGA3Q9Y5H0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHGA3Q9Y5H0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHGA3Q9Y5H0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHGA3Q9Y5H0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHGA3Q9Y5H0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHGA3Q9Y5H0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHGA3Q9Y5H0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHGA3Q9Y5H0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHGA3Q9Y5H0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHGA3Q9Y5H0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHGA3Q9Y5H0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHGA3Q9Y5H0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHGA3Q9Y5H0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHGA3Q9Y5H0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHGA3Q9Y5H0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHGA3Q9Y5H0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHGA3Q9Y5H0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHGA3Q9Y5H0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHGA3Q9Y5H0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHGA3Q9Y5H0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHGA3Q9Y5H0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHGA3Q9Y5H0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHGA3Q9Y5H0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHGA3Q9Y5H0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHGA3Q9Y5H0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHGA3Q9Y5H0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCDHGA3Q9Y5H0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHGA3Q9Y5H0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHGA3Q9Y5H0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHGA3Q9Y5H0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHGA3Q9Y5H0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHGA3Q9Y5H0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHGA3Q9Y5H0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHGA3Q9Y5H0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHGA3Q9Y5H0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHGA3Q9Y5H0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHGA3Q9Y5H0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHGA3Q9Y5H0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHGA3Q9Y5H0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHGA3Q9Y5H0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHGA3Q9Y5H0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHGA3Q9Y5H0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHGA3Q9Y5H0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHGA3Q9Y5H0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHGA3Q9Y5H0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHGA3Q9Y5H0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCDHGA3Q9Y5H0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHGA3Q9Y5H0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHGA3Q9Y5H0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHGA3Q9Y5H0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHGA3Q9Y5H0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHGA3Q9Y5H0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHGA3Q9Y5H0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHGA3Q9Y5H0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHGA3Q9Y5H0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHGA3Q9Y5H0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHGA3Q9Y5H0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHGA3Q9Y5H0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHGA3Q9Y5H0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHGA3Q9Y5H0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHGA3Q9Y5H0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHGA3Q9Y5H0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHGA3Q9Y5H0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHGA3Q9Y5H0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHGA3Q9Y5H0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHGA3Q9Y5H0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHGA3Q9Y5H0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHGA3Q9Y5H0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHGA3Q9Y5H0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHGA3Q9Y5H0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHGA3Q9Y5H0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHGA3Q9Y5H0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHGA3Q9Y5H0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHGA3Q9Y5H0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHGA3Q9Y5H0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHGA3Q9Y5H0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHGA3Q9Y5H0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHGA3Q9Y5H0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PCDHGA3Q9Y5H0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHGA3Q9Y5H0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHGA3Q9Y5H0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHGA3Q9Y5H0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHGA3Q9Y5H0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHGA3Q9Y5H0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHGA3Q9Y5H0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHGA3Q9Y5H0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHGA3Q9Y5H0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHGA3Q9Y5H0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHGA3Q9Y5H0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHGA3Q9Y5H0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms