Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDHB12Q9Y5F1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDHB12Q9Y5F1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDHB12Q9Y5F1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDHB12Q9Y5F1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDHB12Q9Y5F1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDHB12Q9Y5F1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDHB12Q9Y5F1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHB12Q9Y5F1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHB12Q9Y5F1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHB12Q9Y5F1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHB12Q9Y5F1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHB12Q9Y5F1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCDHB12Q9Y5F1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCDHB12Q9Y5F1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHB12Q9Y5F1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCDHB12Q9Y5F1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCDHB12Q9Y5F1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCDHB12Q9Y5F1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCDHB12Q9Y5F1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCDHB12Q9Y5F1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PCDHB12Q9Y5F1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCDHB12Q9Y5F1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCDHB12Q9Y5F1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PCDHB12Q9Y5F1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCDHB12Q9Y5F1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCDHB12Q9Y5F1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHB12Q9Y5F1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHB12Q9Y5F1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHB12Q9Y5F1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHB12Q9Y5F1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHB12Q9Y5F1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHB12Q9Y5F1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCDHB12Q9Y5F1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCDHB12Q9Y5F1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCDHB12Q9Y5F1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCDHB12Q9Y5F1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHB12Q9Y5F1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHB12Q9Y5F1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHB12Q9Y5F1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHB12Q9Y5F1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHB12Q9Y5F1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHB12Q9Y5F1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHB12Q9Y5F1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHB12Q9Y5F1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHB12Q9Y5F1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHB12Q9Y5F1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHB12Q9Y5F1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCDHB12Q9Y5F1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCDHB12Q9Y5F1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDHB12Q9Y5F1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDHB12Q9Y5F1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDHB12Q9Y5F1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDHB12Q9Y5F1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHB12Q9Y5F1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHB12Q9Y5F1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHB12Q9Y5F1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHB12Q9Y5F1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCDHB12Q9Y5F1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PCDHB12Q9Y5F1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCDHB12Q9Y5F1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PCDHB12Q9Y5F1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCDHB12Q9Y5F1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCDHB12Q9Y5F1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCDHB12Q9Y5F1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCDHB12Q9Y5F1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCDHB12Q9Y5F1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCDHB12Q9Y5F1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCDHB12Q9Y5F1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCDHB12Q9Y5F1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCDHB12Q9Y5F1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCDHB12Q9Y5F1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCDHB12Q9Y5F1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDHB12Q9Y5F1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDHB12Q9Y5F1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDHB12Q9Y5F1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDHB12Q9Y5F1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDHB12Q9Y5F1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCDHB12Q9Y5F1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PCDHB12Q9Y5F1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCDHB12Q9Y5F1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCDHB12Q9Y5F1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCDHB12Q9Y5F1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCDHB12Q9Y5F1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDHB12Q9Y5F1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDHB12Q9Y5F1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDHB12Q9Y5F1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDHB12Q9Y5F1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDHB12Q9Y5F1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PCDHB12Q9Y5F1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCDHB12Q9Y5F1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDHB12Q9Y5F1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDHB12Q9Y5F1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDHB12Q9Y5F1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDHB12Q9Y5F1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PCDHB12Q9Y5F1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PCDHB12Q9Y5F1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCDHB12Q9Y5F1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms