Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4R7

TTLL3, Tubulin monoglycylase TTLL3, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3Q9Y4R7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTLL3Q9Y4R7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTLL3Q9Y4R7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTLL3Q9Y4R7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTLL3Q9Y4R7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTLL3Q9Y4R7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTLL3Q9Y4R7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTLL3Q9Y4R7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTLL3Q9Y4R7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTLL3Q9Y4R7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTLL3Q9Y4R7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTLL3Q9Y4R7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTLL3Q9Y4R7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTLL3Q9Y4R7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTLL3Q9Y4R7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTLL3Q9Y4R7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTLL3Q9Y4R7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTLL3Q9Y4R7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTLL3Q9Y4R7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTLL3Q9Y4R7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTLL3Q9Y4R7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTLL3Q9Y4R7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTLL3Q9Y4R7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTLL3Q9Y4R7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTLL3Q9Y4R7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTLL3Q9Y4R7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTLL3Q9Y4R7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTLL3Q9Y4R7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TTLL3Q9Y4R7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTLL3Q9Y4R7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TTLL3Q9Y4R7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTLL3Q9Y4R7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTLL3Q9Y4R7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTLL3Q9Y4R7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTLL3Q9Y4R7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTLL3Q9Y4R7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTLL3Q9Y4R7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTLL3Q9Y4R7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTLL3Q9Y4R7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTLL3Q9Y4R7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTLL3Q9Y4R7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTLL3Q9Y4R7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTLL3Q9Y4R7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTLL3Q9Y4R7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTLL3Q9Y4R7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTLL3Q9Y4R7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTLL3Q9Y4R7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTLL3Q9Y4R7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTLL3Q9Y4R7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTLL3Q9Y4R7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTLL3Q9Y4R7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TTLL3Q9Y4R7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTLL3Q9Y4R7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTLL3Q9Y4R7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTLL3Q9Y4R7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTLL3Q9Y4R7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTLL3Q9Y4R7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTLL3Q9Y4R7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTLL3Q9Y4R7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTLL3Q9Y4R7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TTLL3Q9Y4R7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTLL3Q9Y4R7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTLL3Q9Y4R7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTLL3Q9Y4R7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTLL3Q9Y4R7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTLL3Q9Y4R7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTLL3Q9Y4R7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTLL3Q9Y4R7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTLL3Q9Y4R7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTLL3Q9Y4R7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTLL3Q9Y4R7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTLL3Q9Y4R7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TTLL3Q9Y4R7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TTLL3Q9Y4R7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTLL3Q9Y4R7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTLL3Q9Y4R7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTLL3Q9Y4R7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTLL3Q9Y4R7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTLL3Q9Y4R7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TTLL3Q9Y4R7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTLL3Q9Y4R7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTLL3Q9Y4R7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTLL3Q9Y4R7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTLL3Q9Y4R7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTLL3Q9Y4R7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTLL3Q9Y4R7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTLL3Q9Y4R7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TTLL3Q9Y4R7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTLL3Q9Y4R7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTLL3Q9Y4R7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTLL3Q9Y4R7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTLL3Q9Y4R7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTLL3Q9Y4R7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTLL3Q9Y4R7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTLL3Q9Y4R7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTLL3Q9Y4R7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TTLL3Q9Y4R7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TTLL3Q9Y4R7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTLL3Q9Y4R7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTLL3Q9Y4R7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms