Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y466

NR2E1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2E1Q9Y466 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NR2E1Q9Y466 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NR2E1Q9Y466 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NR2E1Q9Y466 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NR2E1Q9Y466 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NR2E1Q9Y466 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NR2E1Q9Y466 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NR2E1Q9Y466 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NR2E1Q9Y466 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NR2E1Q9Y466 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NR2E1Q9Y466 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NR2E1Q9Y466 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NR2E1Q9Y466 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NR2E1Q9Y466 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NR2E1Q9Y466 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NR2E1Q9Y466 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NR2E1Q9Y466 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NR2E1Q9Y466 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NR2E1Q9Y466 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NR2E1Q9Y466 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NR2E1Q9Y466 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NR2E1Q9Y466 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NR2E1Q9Y466 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NR2E1Q9Y466 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NR2E1Q9Y466 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NR2E1Q9Y466 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NR2E1Q9Y466 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NR2E1Q9Y466 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NR2E1Q9Y466 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NR2E1Q9Y466 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NR2E1Q9Y466 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NR2E1Q9Y466 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NR2E1Q9Y466 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NR2E1Q9Y466 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NR2E1Q9Y466 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NR2E1Q9Y466 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NR2E1Q9Y466 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NR2E1Q9Y466 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NR2E1Q9Y466 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NR2E1Q9Y466 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NR2E1Q9Y466 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NR2E1Q9Y466 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NR2E1Q9Y466 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NR2E1Q9Y466 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NR2E1Q9Y466 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NR2E1Q9Y466 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NR2E1Q9Y466 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NR2E1Q9Y466 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NR2E1Q9Y466 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NR2E1Q9Y466 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NR2E1Q9Y466 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NR2E1Q9Y466 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NR2E1Q9Y466 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NR2E1Q9Y466 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NR2E1Q9Y466 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NR2E1Q9Y466 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NR2E1Q9Y466 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NR2E1Q9Y466 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NR2E1Q9Y466 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NR2E1Q9Y466 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NR2E1Q9Y466 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NR2E1Q9Y466 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NR2E1Q9Y466 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NR2E1Q9Y466 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NR2E1Q9Y466 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NR2E1Q9Y466 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NR2E1Q9Y466 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NR2E1Q9Y466 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NR2E1Q9Y466 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NR2E1Q9Y466 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NR2E1Q9Y466 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NR2E1Q9Y466 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NR2E1Q9Y466 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NR2E1Q9Y466 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NR2E1Q9Y466 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NR2E1Q9Y466 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NR2E1Q9Y466 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NR2E1Q9Y466 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NR2E1Q9Y466 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NR2E1Q9Y466 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NR2E1Q9Y466 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NR2E1Q9Y466 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NR2E1Q9Y466 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NR2E1Q9Y466 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NR2E1Q9Y466 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NR2E1Q9Y466 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NR2E1Q9Y466 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NR2E1Q9Y466 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NR2E1Q9Y466 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NR2E1Q9Y466 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NR2E1Q9Y466 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NR2E1Q9Y466 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NR2E1Q9Y466 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NR2E1Q9Y466 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NR2E1Q9Y466 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NR2E1Q9Y466 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NR2E1Q9Y466 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NR2E1Q9Y466 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NR2E1Q9Y466 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NR2E1Q9Y466 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms