Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRDM4Q9UKN5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRDM4Q9UKN5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRDM4Q9UKN5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRDM4Q9UKN5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRDM4Q9UKN5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRDM4Q9UKN5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRDM4Q9UKN5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRDM4Q9UKN5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRDM4Q9UKN5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRDM4Q9UKN5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRDM4Q9UKN5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRDM4Q9UKN5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRDM4Q9UKN5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRDM4Q9UKN5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PRDM4Q9UKN5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRDM4Q9UKN5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRDM4Q9UKN5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRDM4Q9UKN5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRDM4Q9UKN5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRDM4Q9UKN5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRDM4Q9UKN5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRDM4Q9UKN5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRDM4Q9UKN5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRDM4Q9UKN5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRDM4Q9UKN5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRDM4Q9UKN5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRDM4Q9UKN5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRDM4Q9UKN5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM4Q9UKN5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM4Q9UKN5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM4Q9UKN5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRDM4Q9UKN5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRDM4Q9UKN5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRDM4Q9UKN5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRDM4Q9UKN5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRDM4Q9UKN5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRDM4Q9UKN5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRDM4Q9UKN5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PRDM4Q9UKN5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRDM4Q9UKN5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRDM4Q9UKN5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRDM4Q9UKN5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRDM4Q9UKN5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRDM4Q9UKN5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRDM4Q9UKN5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRDM4Q9UKN5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRDM4Q9UKN5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRDM4Q9UKN5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM4Q9UKN5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM4Q9UKN5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM4Q9UKN5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM4Q9UKN5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM4Q9UKN5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRDM4Q9UKN5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRDM4Q9UKN5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRDM4Q9UKN5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRDM4Q9UKN5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRDM4Q9UKN5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRDM4Q9UKN5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRDM4Q9UKN5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRDM4Q9UKN5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRDM4Q9UKN5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRDM4Q9UKN5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRDM4Q9UKN5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRDM4Q9UKN5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRDM4Q9UKN5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRDM4Q9UKN5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRDM4Q9UKN5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRDM4Q9UKN5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM4Q9UKN5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM4Q9UKN5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM4Q9UKN5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM4Q9UKN5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM4Q9UKN5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM4Q9UKN5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRDM4Q9UKN5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRDM4Q9UKN5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PRDM4Q9UKN5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM4Q9UKN5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM4Q9UKN5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM4Q9UKN5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM4Q9UKN5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM4Q9UKN5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM4Q9UKN5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM4Q9UKN5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM4Q9UKN5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRDM4Q9UKN5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRDM4Q9UKN5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRDM4Q9UKN5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRDM4Q9UKN5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRDM4Q9UKN5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRDM4Q9UKN5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRDM4Q9UKN5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRDM4Q9UKN5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRDM4Q9UKN5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM4Q9UKN5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM4Q9UKN5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM4Q9UKN5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM4Q9UKN5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms