Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS0

RPS6KB2, Ribosomal protein S6 kinase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB2Q9UBS0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KB2Q9UBS0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KB2Q9UBS0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KB2Q9UBS0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KB2Q9UBS0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KB2Q9UBS0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KB2Q9UBS0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KB2Q9UBS0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KB2Q9UBS0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KB2Q9UBS0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KB2Q9UBS0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KB2Q9UBS0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KB2Q9UBS0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KB2Q9UBS0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KB2Q9UBS0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KB2Q9UBS0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KB2Q9UBS0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KB2Q9UBS0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KB2Q9UBS0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KB2Q9UBS0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KB2Q9UBS0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KB2Q9UBS0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KB2Q9UBS0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KB2Q9UBS0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KB2Q9UBS0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KB2Q9UBS0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KB2Q9UBS0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KB2Q9UBS0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KB2Q9UBS0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KB2Q9UBS0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KB2Q9UBS0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KB2Q9UBS0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KB2Q9UBS0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KB2Q9UBS0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KB2Q9UBS0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KB2Q9UBS0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KB2Q9UBS0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KB2Q9UBS0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KB2Q9UBS0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KB2Q9UBS0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KB2Q9UBS0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KB2Q9UBS0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KB2Q9UBS0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KB2Q9UBS0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KB2Q9UBS0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KB2Q9UBS0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KB2Q9UBS0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KB2Q9UBS0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KB2Q9UBS0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KB2Q9UBS0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KB2Q9UBS0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KB2Q9UBS0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KB2Q9UBS0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KB2Q9UBS0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KB2Q9UBS0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KB2Q9UBS0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KB2Q9UBS0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KB2Q9UBS0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS6KB2Q9UBS0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS6KB2Q9UBS0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS6KB2Q9UBS0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS6KB2Q9UBS0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPS6KB2Q9UBS0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPS6KB2Q9UBS0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS6KB2Q9UBS0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KB2Q9UBS0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KB2Q9UBS0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KB2Q9UBS0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KB2Q9UBS0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KB2Q9UBS0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KB2Q9UBS0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KB2Q9UBS0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KB2Q9UBS0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KB2Q9UBS0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KB2Q9UBS0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KB2Q9UBS0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KB2Q9UBS0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KB2Q9UBS0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KB2Q9UBS0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KB2Q9UBS0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KB2Q9UBS0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KB2Q9UBS0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KB2Q9UBS0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KB2Q9UBS0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KB2Q9UBS0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KB2Q9UBS0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KB2Q9UBS0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KB2Q9UBS0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KB2Q9UBS0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KB2Q9UBS0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KB2Q9UBS0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KB2Q9UBS0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS6KB2Q9UBS0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPS6KB2Q9UBS0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KB2Q9UBS0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KB2Q9UBS0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KB2Q9UBS0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KB2Q9UBS0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KB2Q9UBS0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KB2Q9UBS0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms