Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
CC2D2AQ9P2K1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
CC2D2AQ9P2K1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC47.26■■■■■ 5.16
CC2D2AQ9P2K1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC47.25■■■■■ 5.15
CC2D2AQ9P2K1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC47.25■■■■■ 5.15
CC2D2AQ9P2K1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.25■■■■■ 5.15
CC2D2AQ9P2K1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC47.25■■■■■ 5.15
CC2D2AQ9P2K1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.25■■■■■ 5.15
CC2D2AQ9P2K1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC47.24■■■■■ 5.15
CC2D2AQ9P2K1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.24■■■■■ 5.15
CC2D2AQ9P2K1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.23■■■■■ 5.15
CC2D2AQ9P2K1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC47.23■■■■■ 5.15
CC2D2AQ9P2K1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
CC2D2AQ9P2K1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC47.19■■■■■ 5.15
CC2D2AQ9P2K1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.19■■■■■ 5.15
CC2D2AQ9P2K1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.19■■■■■ 5.15
CC2D2AQ9P2K1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC47.19■■■■■ 5.15
CC2D2AQ9P2K1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC47.19■■■■■ 5.14
CC2D2AQ9P2K1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
CC2D2AQ9P2K1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
CC2D2AQ9P2K1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
CC2D2AQ9P2K1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
CC2D2AQ9P2K1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
CC2D2AQ9P2K1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
CC2D2AQ9P2K1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
CC2D2AQ9P2K1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC47.15■■■■■ 5.14
CC2D2AQ9P2K1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC47.15■■■■■ 5.14
CC2D2AQ9P2K1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC47.13■■■■■ 5.14
CC2D2AQ9P2K1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.13■■■■■ 5.14
CC2D2AQ9P2K1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC47.13■■■■■ 5.13
CC2D2AQ9P2K1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC47.12■■■■■ 5.13
CC2D2AQ9P2K1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC47.12■■■■■ 5.13
CC2D2AQ9P2K1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC47.12■■■■■ 5.13
CC2D2AQ9P2K1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.12■■■■■ 5.13
CC2D2AQ9P2K1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC47.12■■■■■ 5.13
CC2D2AQ9P2K1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC47.12■■■■■ 5.13
CC2D2AQ9P2K1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC47.11■■■■■ 5.13
CC2D2AQ9P2K1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.11■■■■■ 5.13
CC2D2AQ9P2K1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.11■■■■■ 5.13
CC2D2AQ9P2K1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC47.11■■■■■ 5.13
CC2D2AQ9P2K1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC47.11■■■■■ 5.13
CC2D2AQ9P2K1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.11■■■■■ 5.13
CC2D2AQ9P2K1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.1■■■■■ 5.13
CC2D2AQ9P2K1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
CC2D2AQ9P2K1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC47.09■■■■■ 5.13
CC2D2AQ9P2K1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC47.09■■■■■ 5.13
CC2D2AQ9P2K1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC47.09■■■■■ 5.13
CC2D2AQ9P2K1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
CC2D2AQ9P2K1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC47.08■■■■■ 5.13
CC2D2AQ9P2K1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.06■■■■■ 5.12
CC2D2AQ9P2K1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC47.05■■■■■ 5.12
CC2D2AQ9P2K1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC47.05■■■■■ 5.12
CC2D2AQ9P2K1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC47.05■■■■■ 5.12
CC2D2AQ9P2K1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.04■■■■■ 5.12
CC2D2AQ9P2K1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC47.04■■■■■ 5.12
CC2D2AQ9P2K1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC47.03■■■■■ 5.12
CC2D2AQ9P2K1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.03■■■■■ 5.12
CC2D2AQ9P2K1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.03■■■■■ 5.12
CC2D2AQ9P2K1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
CC2D2AQ9P2K1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
CC2D2AQ9P2K1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC47.01■■■■■ 5.12
CC2D2AQ9P2K1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC47.01■■■■■ 5.12
CC2D2AQ9P2K1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.01■■■■■ 5.12
CC2D2AQ9P2K1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
CC2D2AQ9P2K1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC47.01■■■■■ 5.12
CC2D2AQ9P2K1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47■■■■■ 5.11
CC2D2AQ9P2K1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC47■■■■■ 5.11
CC2D2AQ9P2K1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.99■■■■■ 5.11
CC2D2AQ9P2K1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC46.99■■■■■ 5.11
CC2D2AQ9P2K1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.98■■■■■ 5.11
CC2D2AQ9P2K1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.98■■■■■ 5.11
CC2D2AQ9P2K1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC46.98■■■■■ 5.11
CC2D2AQ9P2K1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC46.98■■■■■ 5.11
CC2D2AQ9P2K1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.96■■■■■ 5.11
CC2D2AQ9P2K1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC46.95■■■■■ 5.11
CC2D2AQ9P2K1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC46.94■■■■■ 5.11
CC2D2AQ9P2K1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.94■■■■■ 5.1
CC2D2AQ9P2K1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.94■■■■■ 5.1
CC2D2AQ9P2K1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC46.94■■■■■ 5.1
CC2D2AQ9P2K1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
CC2D2AQ9P2K1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC46.93■■■■■ 5.1
CC2D2AQ9P2K1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC46.92■■■■■ 5.1
CC2D2AQ9P2K1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC46.92■■■■■ 5.1
CC2D2AQ9P2K1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC46.91■■■■■ 5.1
CC2D2AQ9P2K1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC46.9■■■■■ 5.1
CC2D2AQ9P2K1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC46.9■■■■■ 5.1
CC2D2AQ9P2K1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC46.9■■■■■ 5.1
CC2D2AQ9P2K1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.9■■■■■ 5.1
CC2D2AQ9P2K1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.89■■■■■ 5.1
CC2D2AQ9P2K1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC46.89■■■■■ 5.1
CC2D2AQ9P2K1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC46.89■■■■■ 5.1
CC2D2AQ9P2K1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.1
CC2D2AQ9P2K1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC46.88■■■■■ 5.1
CC2D2AQ9P2K1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.88■■■■■ 5.1
CC2D2AQ9P2K1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.87■■■■■ 5.09
CC2D2AQ9P2K1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.87■■■■■ 5.09
CC2D2AQ9P2K1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.87■■■■■ 5.09
CC2D2AQ9P2K1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC46.87■■■■■ 5.09
CC2D2AQ9P2K1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC46.86■■■■■ 5.09
CC2D2AQ9P2K1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.86■■■■■ 5.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms