Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
USP35Q9P2H5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
USP35Q9P2H5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
USP35Q9P2H5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
USP35Q9P2H5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
USP35Q9P2H5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
USP35Q9P2H5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
USP35Q9P2H5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
USP35Q9P2H5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
USP35Q9P2H5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
USP35Q9P2H5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
USP35Q9P2H5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
USP35Q9P2H5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
USP35Q9P2H5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
USP35Q9P2H5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
USP35Q9P2H5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
USP35Q9P2H5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
USP35Q9P2H5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
USP35Q9P2H5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
USP35Q9P2H5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
USP35Q9P2H5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
USP35Q9P2H5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
USP35Q9P2H5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
USP35Q9P2H5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
USP35Q9P2H5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
USP35Q9P2H5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
USP35Q9P2H5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
USP35Q9P2H5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
USP35Q9P2H5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
USP35Q9P2H5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
USP35Q9P2H5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
USP35Q9P2H5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
USP35Q9P2H5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
USP35Q9P2H5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
USP35Q9P2H5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
USP35Q9P2H5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
USP35Q9P2H5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
USP35Q9P2H5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
USP35Q9P2H5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
USP35Q9P2H5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
USP35Q9P2H5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
USP35Q9P2H5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
USP35Q9P2H5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
USP35Q9P2H5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
USP35Q9P2H5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
USP35Q9P2H5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
USP35Q9P2H5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
USP35Q9P2H5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
USP35Q9P2H5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
USP35Q9P2H5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
USP35Q9P2H5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
USP35Q9P2H5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
USP35Q9P2H5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
USP35Q9P2H5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
USP35Q9P2H5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
USP35Q9P2H5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
USP35Q9P2H5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
USP35Q9P2H5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
USP35Q9P2H5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
USP35Q9P2H5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
USP35Q9P2H5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
USP35Q9P2H5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
USP35Q9P2H5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
USP35Q9P2H5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
USP35Q9P2H5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
USP35Q9P2H5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
USP35Q9P2H5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
USP35Q9P2H5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
USP35Q9P2H5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
USP35Q9P2H5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
USP35Q9P2H5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
USP35Q9P2H5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
USP35Q9P2H5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
USP35Q9P2H5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
USP35Q9P2H5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
USP35Q9P2H5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC34.22■■■■□ 3.07
USP35Q9P2H5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
USP35Q9P2H5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
USP35Q9P2H5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
USP35Q9P2H5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
USP35Q9P2H5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
USP35Q9P2H5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
USP35Q9P2H5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
USP35Q9P2H5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
USP35Q9P2H5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
USP35Q9P2H5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
USP35Q9P2H5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
USP35Q9P2H5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
USP35Q9P2H5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
USP35Q9P2H5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
USP35Q9P2H5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
USP35Q9P2H5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.17■■■■□ 3.06
USP35Q9P2H5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
USP35Q9P2H5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
USP35Q9P2H5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
USP35Q9P2H5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
USP35Q9P2H5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
USP35Q9P2H5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
USP35Q9P2H5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
USP35Q9P2H5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms