Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC59Q9P031 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC59Q9P031 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC59Q9P031 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC59Q9P031 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC59Q9P031 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC59Q9P031 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC59Q9P031 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC59Q9P031 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC59Q9P031 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC59Q9P031 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC59Q9P031 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC59Q9P031 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC59Q9P031 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC59Q9P031 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC59Q9P031 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC59Q9P031 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC59Q9P031 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC59Q9P031 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC59Q9P031 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC59Q9P031 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC59Q9P031 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC59Q9P031 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC59Q9P031 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC59Q9P031 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC59Q9P031 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC59Q9P031 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC59Q9P031 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC59Q9P031 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC59Q9P031 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC59Q9P031 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC59Q9P031 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC59Q9P031 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC59Q9P031 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC59Q9P031 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC59Q9P031 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC59Q9P031 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC59Q9P031 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC59Q9P031 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC59Q9P031 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC59Q9P031 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC59Q9P031 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC59Q9P031 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC59Q9P031 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC59Q9P031 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC59Q9P031 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC59Q9P031 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC59Q9P031 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC59Q9P031 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC59Q9P031 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC59Q9P031 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC59Q9P031 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC59Q9P031 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC59Q9P031 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC59Q9P031 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC59Q9P031 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC59Q9P031 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC59Q9P031 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC59Q9P031 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC59Q9P031 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC59Q9P031 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC59Q9P031 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC59Q9P031 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC59Q9P031 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC59Q9P031 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC59Q9P031 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC59Q9P031 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC59Q9P031 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC59Q9P031 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC59Q9P031 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC59Q9P031 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC59Q9P031 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC59Q9P031 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC59Q9P031 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC59Q9P031 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC59Q9P031 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC59Q9P031 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC59Q9P031 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC59Q9P031 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC59Q9P031 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC59Q9P031 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC59Q9P031 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC59Q9P031 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC59Q9P031 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC59Q9P031 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC59Q9P031 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC59Q9P031 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC59Q9P031 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC59Q9P031 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC59Q9P031 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC59Q9P031 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC59Q9P031 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC59Q9P031 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC59Q9P031 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC59Q9P031 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC59Q9P031 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC59Q9P031 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC59Q9P031 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC59Q9P031 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC59Q9P031 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 301.4 ms