Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ3

NCKIPSD, NCK-interacting protein with SH3 domain, humanhuman

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKIPSDQ9NZQ3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCKIPSDQ9NZQ3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCKIPSDQ9NZQ3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCKIPSDQ9NZQ3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCKIPSDQ9NZQ3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCKIPSDQ9NZQ3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCKIPSDQ9NZQ3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCKIPSDQ9NZQ3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCKIPSDQ9NZQ3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCKIPSDQ9NZQ3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCKIPSDQ9NZQ3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCKIPSDQ9NZQ3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NCKIPSDQ9NZQ3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCKIPSDQ9NZQ3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCKIPSDQ9NZQ3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCKIPSDQ9NZQ3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCKIPSDQ9NZQ3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCKIPSDQ9NZQ3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCKIPSDQ9NZQ3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCKIPSDQ9NZQ3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCKIPSDQ9NZQ3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCKIPSDQ9NZQ3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCKIPSDQ9NZQ3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCKIPSDQ9NZQ3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCKIPSDQ9NZQ3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
NCKIPSDQ9NZQ3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
NCKIPSDQ9NZQ3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCKIPSDQ9NZQ3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCKIPSDQ9NZQ3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCKIPSDQ9NZQ3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCKIPSDQ9NZQ3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCKIPSDQ9NZQ3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCKIPSDQ9NZQ3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NCKIPSDQ9NZQ3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCKIPSDQ9NZQ3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCKIPSDQ9NZQ3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCKIPSDQ9NZQ3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCKIPSDQ9NZQ3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCKIPSDQ9NZQ3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NCKIPSDQ9NZQ3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NCKIPSDQ9NZQ3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCKIPSDQ9NZQ3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCKIPSDQ9NZQ3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCKIPSDQ9NZQ3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCKIPSDQ9NZQ3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCKIPSDQ9NZQ3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCKIPSDQ9NZQ3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCKIPSDQ9NZQ3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCKIPSDQ9NZQ3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCKIPSDQ9NZQ3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCKIPSDQ9NZQ3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCKIPSDQ9NZQ3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCKIPSDQ9NZQ3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NCKIPSDQ9NZQ3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCKIPSDQ9NZQ3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCKIPSDQ9NZQ3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCKIPSDQ9NZQ3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCKIPSDQ9NZQ3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCKIPSDQ9NZQ3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCKIPSDQ9NZQ3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCKIPSDQ9NZQ3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCKIPSDQ9NZQ3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCKIPSDQ9NZQ3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCKIPSDQ9NZQ3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCKIPSDQ9NZQ3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCKIPSDQ9NZQ3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCKIPSDQ9NZQ3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCKIPSDQ9NZQ3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NCKIPSDQ9NZQ3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NCKIPSDQ9NZQ3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NCKIPSDQ9NZQ3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCKIPSDQ9NZQ3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCKIPSDQ9NZQ3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCKIPSDQ9NZQ3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCKIPSDQ9NZQ3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCKIPSDQ9NZQ3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCKIPSDQ9NZQ3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCKIPSDQ9NZQ3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCKIPSDQ9NZQ3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCKIPSDQ9NZQ3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCKIPSDQ9NZQ3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCKIPSDQ9NZQ3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCKIPSDQ9NZQ3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCKIPSDQ9NZQ3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCKIPSDQ9NZQ3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCKIPSDQ9NZQ3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCKIPSDQ9NZQ3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCKIPSDQ9NZQ3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NCKIPSDQ9NZQ3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCKIPSDQ9NZQ3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCKIPSDQ9NZQ3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCKIPSDQ9NZQ3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCKIPSDQ9NZQ3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCKIPSDQ9NZQ3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCKIPSDQ9NZQ3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCKIPSDQ9NZQ3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms