Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGPEP1Q9NXJ5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGPEP1Q9NXJ5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGPEP1Q9NXJ5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGPEP1Q9NXJ5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGPEP1Q9NXJ5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGPEP1Q9NXJ5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGPEP1Q9NXJ5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGPEP1Q9NXJ5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGPEP1Q9NXJ5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGPEP1Q9NXJ5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGPEP1Q9NXJ5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGPEP1Q9NXJ5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGPEP1Q9NXJ5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGPEP1Q9NXJ5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGPEP1Q9NXJ5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGPEP1Q9NXJ5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PGPEP1Q9NXJ5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PGPEP1Q9NXJ5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGPEP1Q9NXJ5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGPEP1Q9NXJ5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGPEP1Q9NXJ5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGPEP1Q9NXJ5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGPEP1Q9NXJ5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGPEP1Q9NXJ5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGPEP1Q9NXJ5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGPEP1Q9NXJ5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGPEP1Q9NXJ5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGPEP1Q9NXJ5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGPEP1Q9NXJ5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGPEP1Q9NXJ5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGPEP1Q9NXJ5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGPEP1Q9NXJ5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGPEP1Q9NXJ5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGPEP1Q9NXJ5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGPEP1Q9NXJ5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGPEP1Q9NXJ5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGPEP1Q9NXJ5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGPEP1Q9NXJ5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGPEP1Q9NXJ5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PGPEP1Q9NXJ5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGPEP1Q9NXJ5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGPEP1Q9NXJ5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGPEP1Q9NXJ5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGPEP1Q9NXJ5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGPEP1Q9NXJ5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGPEP1Q9NXJ5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGPEP1Q9NXJ5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGPEP1Q9NXJ5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGPEP1Q9NXJ5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGPEP1Q9NXJ5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGPEP1Q9NXJ5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGPEP1Q9NXJ5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGPEP1Q9NXJ5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGPEP1Q9NXJ5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGPEP1Q9NXJ5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGPEP1Q9NXJ5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGPEP1Q9NXJ5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGPEP1Q9NXJ5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGPEP1Q9NXJ5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGPEP1Q9NXJ5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGPEP1Q9NXJ5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGPEP1Q9NXJ5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PGPEP1Q9NXJ5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PGPEP1Q9NXJ5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGPEP1Q9NXJ5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGPEP1Q9NXJ5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGPEP1Q9NXJ5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGPEP1Q9NXJ5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGPEP1Q9NXJ5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGPEP1Q9NXJ5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGPEP1Q9NXJ5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGPEP1Q9NXJ5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGPEP1Q9NXJ5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGPEP1Q9NXJ5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGPEP1Q9NXJ5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGPEP1Q9NXJ5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGPEP1Q9NXJ5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGPEP1Q9NXJ5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGPEP1Q9NXJ5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGPEP1Q9NXJ5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGPEP1Q9NXJ5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGPEP1Q9NXJ5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGPEP1Q9NXJ5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGPEP1Q9NXJ5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGPEP1Q9NXJ5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGPEP1Q9NXJ5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PGPEP1Q9NXJ5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PGPEP1Q9NXJ5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGPEP1Q9NXJ5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGPEP1Q9NXJ5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGPEP1Q9NXJ5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGPEP1Q9NXJ5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGPEP1Q9NXJ5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PGPEP1Q9NXJ5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGPEP1Q9NXJ5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.3 ms