Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWF4

SLC52A1, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 1, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A1Q9NWF4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
SLC52A1Q9NWF4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
SLC52A1Q9NWF4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
SLC52A1Q9NWF4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
SLC52A1Q9NWF4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
SLC52A1Q9NWF4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
SLC52A1Q9NWF4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
SLC52A1Q9NWF4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
SLC52A1Q9NWF4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
SLC52A1Q9NWF4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
SLC52A1Q9NWF4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
SLC52A1Q9NWF4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
SLC52A1Q9NWF4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
SLC52A1Q9NWF4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
SLC52A1Q9NWF4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
SLC52A1Q9NWF4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SLC52A1Q9NWF4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SLC52A1Q9NWF4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SLC52A1Q9NWF4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SLC52A1Q9NWF4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
SLC52A1Q9NWF4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
SLC52A1Q9NWF4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
SLC52A1Q9NWF4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
SLC52A1Q9NWF4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
SLC52A1Q9NWF4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
SLC52A1Q9NWF4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
SLC52A1Q9NWF4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
SLC52A1Q9NWF4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
SLC52A1Q9NWF4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
SLC52A1Q9NWF4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
SLC52A1Q9NWF4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
SLC52A1Q9NWF4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
SLC52A1Q9NWF4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
SLC52A1Q9NWF4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
SLC52A1Q9NWF4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
SLC52A1Q9NWF4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
SLC52A1Q9NWF4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
SLC52A1Q9NWF4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
SLC52A1Q9NWF4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
SLC52A1Q9NWF4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
SLC52A1Q9NWF4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
SLC52A1Q9NWF4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
SLC52A1Q9NWF4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
SLC52A1Q9NWF4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
SLC52A1Q9NWF4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
SLC52A1Q9NWF4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
SLC52A1Q9NWF4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
SLC52A1Q9NWF4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
SLC52A1Q9NWF4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
SLC52A1Q9NWF4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
SLC52A1Q9NWF4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37.06■■■■□ 3.52
SLC52A1Q9NWF4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SLC52A1Q9NWF4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SLC52A1Q9NWF4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SLC52A1Q9NWF4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
SLC52A1Q9NWF4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
SLC52A1Q9NWF4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
SLC52A1Q9NWF4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SLC52A1Q9NWF4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
SLC52A1Q9NWF4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SLC52A1Q9NWF4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
SLC52A1Q9NWF4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
SLC52A1Q9NWF4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
SLC52A1Q9NWF4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
SLC52A1Q9NWF4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
SLC52A1Q9NWF4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
SLC52A1Q9NWF4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
SLC52A1Q9NWF4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SLC52A1Q9NWF4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
SLC52A1Q9NWF4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
SLC52A1Q9NWF4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
SLC52A1Q9NWF4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
SLC52A1Q9NWF4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
SLC52A1Q9NWF4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
SLC52A1Q9NWF4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
SLC52A1Q9NWF4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
SLC52A1Q9NWF4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
SLC52A1Q9NWF4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
SLC52A1Q9NWF4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
SLC52A1Q9NWF4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
SLC52A1Q9NWF4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
SLC52A1Q9NWF4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC36.92■■■■□ 3.5
SLC52A1Q9NWF4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
SLC52A1Q9NWF4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
SLC52A1Q9NWF4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
SLC52A1Q9NWF4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
SLC52A1Q9NWF4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
SLC52A1Q9NWF4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
SLC52A1Q9NWF4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
SLC52A1Q9NWF4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
SLC52A1Q9NWF4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
SLC52A1Q9NWF4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
SLC52A1Q9NWF4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SLC52A1Q9NWF4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SLC52A1Q9NWF4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SLC52A1Q9NWF4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
SLC52A1Q9NWF4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SLC52A1Q9NWF4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SLC52A1Q9NWF4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
SLC52A1Q9NWF4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms