Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVN3

RIC8B, Synembryn-B, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIC8BQ9NVN3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIC8BQ9NVN3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RIC8BQ9NVN3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIC8BQ9NVN3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIC8BQ9NVN3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIC8BQ9NVN3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIC8BQ9NVN3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIC8BQ9NVN3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIC8BQ9NVN3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIC8BQ9NVN3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIC8BQ9NVN3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIC8BQ9NVN3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIC8BQ9NVN3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIC8BQ9NVN3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIC8BQ9NVN3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIC8BQ9NVN3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIC8BQ9NVN3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIC8BQ9NVN3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIC8BQ9NVN3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIC8BQ9NVN3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIC8BQ9NVN3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIC8BQ9NVN3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIC8BQ9NVN3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIC8BQ9NVN3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIC8BQ9NVN3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RIC8BQ9NVN3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RIC8BQ9NVN3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIC8BQ9NVN3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIC8BQ9NVN3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIC8BQ9NVN3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIC8BQ9NVN3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIC8BQ9NVN3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIC8BQ9NVN3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIC8BQ9NVN3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIC8BQ9NVN3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIC8BQ9NVN3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIC8BQ9NVN3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIC8BQ9NVN3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIC8BQ9NVN3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIC8BQ9NVN3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIC8BQ9NVN3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIC8BQ9NVN3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIC8BQ9NVN3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIC8BQ9NVN3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIC8BQ9NVN3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIC8BQ9NVN3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RIC8BQ9NVN3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIC8BQ9NVN3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIC8BQ9NVN3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIC8BQ9NVN3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RIC8BQ9NVN3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIC8BQ9NVN3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIC8BQ9NVN3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIC8BQ9NVN3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIC8BQ9NVN3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RIC8BQ9NVN3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIC8BQ9NVN3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIC8BQ9NVN3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIC8BQ9NVN3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIC8BQ9NVN3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIC8BQ9NVN3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIC8BQ9NVN3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIC8BQ9NVN3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIC8BQ9NVN3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIC8BQ9NVN3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIC8BQ9NVN3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIC8BQ9NVN3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIC8BQ9NVN3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIC8BQ9NVN3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIC8BQ9NVN3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIC8BQ9NVN3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIC8BQ9NVN3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIC8BQ9NVN3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIC8BQ9NVN3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIC8BQ9NVN3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIC8BQ9NVN3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIC8BQ9NVN3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RIC8BQ9NVN3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIC8BQ9NVN3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIC8BQ9NVN3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIC8BQ9NVN3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIC8BQ9NVN3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIC8BQ9NVN3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIC8BQ9NVN3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIC8BQ9NVN3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIC8BQ9NVN3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIC8BQ9NVN3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIC8BQ9NVN3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RIC8BQ9NVN3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIC8BQ9NVN3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIC8BQ9NVN3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIC8BQ9NVN3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RIC8BQ9NVN3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIC8BQ9NVN3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIC8BQ9NVN3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIC8BQ9NVN3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIC8BQ9NVN3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIC8BQ9NVN3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIC8BQ9NVN3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIC8BQ9NVN3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms