Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS64

RPRM, Protein reprimo, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMQ9NS64 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPRMQ9NS64 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPRMQ9NS64 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPRMQ9NS64 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPRMQ9NS64 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPRMQ9NS64 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPRMQ9NS64 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPRMQ9NS64 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPRMQ9NS64 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPRMQ9NS64 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPRMQ9NS64 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RPRMQ9NS64 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPRMQ9NS64 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPRMQ9NS64 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPRMQ9NS64 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPRMQ9NS64 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPRMQ9NS64 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RPRMQ9NS64 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RPRMQ9NS64 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPRMQ9NS64 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPRMQ9NS64 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPRMQ9NS64 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPRMQ9NS64 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPRMQ9NS64 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPRMQ9NS64 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPRMQ9NS64 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPRMQ9NS64 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPRMQ9NS64 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPRMQ9NS64 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPRMQ9NS64 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPRMQ9NS64 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPRMQ9NS64 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPRMQ9NS64 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPRMQ9NS64 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPRMQ9NS64 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPRMQ9NS64 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPRMQ9NS64 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPRMQ9NS64 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPRMQ9NS64 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPRMQ9NS64 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPRMQ9NS64 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPRMQ9NS64 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPRMQ9NS64 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPRMQ9NS64 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPRMQ9NS64 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPRMQ9NS64 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RPRMQ9NS64 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPRMQ9NS64 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPRMQ9NS64 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPRMQ9NS64 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPRMQ9NS64 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPRMQ9NS64 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPRMQ9NS64 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPRMQ9NS64 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPRMQ9NS64 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPRMQ9NS64 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RPRMQ9NS64 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPRMQ9NS64 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPRMQ9NS64 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPRMQ9NS64 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPRMQ9NS64 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPRMQ9NS64 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPRMQ9NS64 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPRMQ9NS64 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPRMQ9NS64 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPRMQ9NS64 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPRMQ9NS64 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPRMQ9NS64 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPRMQ9NS64 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPRMQ9NS64 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPRMQ9NS64 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPRMQ9NS64 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPRMQ9NS64 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPRMQ9NS64 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RPRMQ9NS64 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RPRMQ9NS64 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPRMQ9NS64 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPRMQ9NS64 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPRMQ9NS64 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPRMQ9NS64 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RPRMQ9NS64 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RPRMQ9NS64 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPRMQ9NS64 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPRMQ9NS64 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPRMQ9NS64 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPRMQ9NS64 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPRMQ9NS64 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPRMQ9NS64 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPRMQ9NS64 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPRMQ9NS64 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPRMQ9NS64 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPRMQ9NS64 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPRMQ9NS64 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPRMQ9NS64 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPRMQ9NS64 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPRMQ9NS64 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPRMQ9NS64 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPRMQ9NS64 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPRMQ9NS64 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPRMQ9NS64 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms