Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MMP26Q9NRE1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MMP26Q9NRE1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MMP26Q9NRE1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MMP26Q9NRE1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MMP26Q9NRE1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MMP26Q9NRE1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MMP26Q9NRE1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MMP26Q9NRE1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MMP26Q9NRE1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MMP26Q9NRE1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MMP26Q9NRE1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MMP26Q9NRE1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MMP26Q9NRE1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MMP26Q9NRE1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MMP26Q9NRE1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MMP26Q9NRE1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MMP26Q9NRE1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MMP26Q9NRE1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MMP26Q9NRE1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MMP26Q9NRE1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MMP26Q9NRE1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP26Q9NRE1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP26Q9NRE1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP26Q9NRE1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP26Q9NRE1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP26Q9NRE1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP26Q9NRE1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP26Q9NRE1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP26Q9NRE1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP26Q9NRE1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP26Q9NRE1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP26Q9NRE1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP26Q9NRE1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP26Q9NRE1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP26Q9NRE1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP26Q9NRE1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP26Q9NRE1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP26Q9NRE1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP26Q9NRE1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP26Q9NRE1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP26Q9NRE1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP26Q9NRE1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP26Q9NRE1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP26Q9NRE1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP26Q9NRE1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP26Q9NRE1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP26Q9NRE1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP26Q9NRE1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP26Q9NRE1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP26Q9NRE1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP26Q9NRE1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP26Q9NRE1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP26Q9NRE1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP26Q9NRE1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP26Q9NRE1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP26Q9NRE1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP26Q9NRE1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP26Q9NRE1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP26Q9NRE1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP26Q9NRE1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MMP26Q9NRE1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP26Q9NRE1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP26Q9NRE1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP26Q9NRE1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP26Q9NRE1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP26Q9NRE1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP26Q9NRE1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP26Q9NRE1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP26Q9NRE1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP26Q9NRE1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP26Q9NRE1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP26Q9NRE1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP26Q9NRE1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP26Q9NRE1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP26Q9NRE1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP26Q9NRE1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP26Q9NRE1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP26Q9NRE1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP26Q9NRE1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP26Q9NRE1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP26Q9NRE1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP26Q9NRE1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP26Q9NRE1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP26Q9NRE1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP26Q9NRE1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP26Q9NRE1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP26Q9NRE1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP26Q9NRE1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP26Q9NRE1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP26Q9NRE1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP26Q9NRE1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP26Q9NRE1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP26Q9NRE1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP26Q9NRE1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP26Q9NRE1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP26Q9NRE1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP26Q9NRE1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP26Q9NRE1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP26Q9NRE1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms