Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP59

SLC40A1, Solute carrier family 40 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC40A1Q9NP59 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC40A1Q9NP59 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC40A1Q9NP59 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC40A1Q9NP59 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC40A1Q9NP59 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC40A1Q9NP59 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC40A1Q9NP59 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC40A1Q9NP59 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC40A1Q9NP59 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC40A1Q9NP59 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC40A1Q9NP59 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC40A1Q9NP59 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC40A1Q9NP59 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC40A1Q9NP59 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC40A1Q9NP59 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC40A1Q9NP59 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC40A1Q9NP59 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC40A1Q9NP59 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC40A1Q9NP59 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC40A1Q9NP59 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC40A1Q9NP59 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC40A1Q9NP59 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC40A1Q9NP59 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC40A1Q9NP59 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC40A1Q9NP59 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC40A1Q9NP59 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC40A1Q9NP59 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC40A1Q9NP59 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC40A1Q9NP59 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC40A1Q9NP59 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC40A1Q9NP59 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC40A1Q9NP59 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC40A1Q9NP59 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC40A1Q9NP59 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC40A1Q9NP59 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC40A1Q9NP59 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC40A1Q9NP59 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC40A1Q9NP59 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC40A1Q9NP59 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC40A1Q9NP59 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC40A1Q9NP59 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC40A1Q9NP59 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC40A1Q9NP59 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC40A1Q9NP59 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC40A1Q9NP59 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC40A1Q9NP59 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC40A1Q9NP59 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC40A1Q9NP59 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC40A1Q9NP59 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC40A1Q9NP59 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC40A1Q9NP59 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC40A1Q9NP59 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC40A1Q9NP59 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC40A1Q9NP59 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC40A1Q9NP59 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC40A1Q9NP59 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC40A1Q9NP59 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC40A1Q9NP59 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC40A1Q9NP59 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC40A1Q9NP59 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC40A1Q9NP59 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC40A1Q9NP59 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC40A1Q9NP59 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC40A1Q9NP59 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC40A1Q9NP59 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC40A1Q9NP59 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC40A1Q9NP59 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC40A1Q9NP59 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC40A1Q9NP59 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC40A1Q9NP59 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC40A1Q9NP59 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC40A1Q9NP59 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC40A1Q9NP59 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC40A1Q9NP59 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC40A1Q9NP59 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC40A1Q9NP59 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC40A1Q9NP59 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC40A1Q9NP59 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC40A1Q9NP59 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC40A1Q9NP59 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC40A1Q9NP59 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC40A1Q9NP59 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC40A1Q9NP59 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC40A1Q9NP59 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC40A1Q9NP59 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC40A1Q9NP59 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC40A1Q9NP59 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC40A1Q9NP59 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC40A1Q9NP59 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC40A1Q9NP59 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC40A1Q9NP59 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC40A1Q9NP59 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC40A1Q9NP59 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC40A1Q9NP59 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC40A1Q9NP59 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC40A1Q9NP59 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC40A1Q9NP59 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC40A1Q9NP59 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC40A1Q9NP59 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC40A1Q9NP59 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms