Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8K7

C10orf88, Uncharacterized protein C10orf88, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf88Q9H8K7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C10orf88Q9H8K7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C10orf88Q9H8K7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C10orf88Q9H8K7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C10orf88Q9H8K7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C10orf88Q9H8K7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C10orf88Q9H8K7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
C10orf88Q9H8K7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C10orf88Q9H8K7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C10orf88Q9H8K7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C10orf88Q9H8K7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C10orf88Q9H8K7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C10orf88Q9H8K7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C10orf88Q9H8K7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C10orf88Q9H8K7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C10orf88Q9H8K7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C10orf88Q9H8K7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C10orf88Q9H8K7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C10orf88Q9H8K7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
C10orf88Q9H8K7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
C10orf88Q9H8K7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
C10orf88Q9H8K7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
C10orf88Q9H8K7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
C10orf88Q9H8K7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
C10orf88Q9H8K7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C10orf88Q9H8K7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C10orf88Q9H8K7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C10orf88Q9H8K7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C10orf88Q9H8K7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
C10orf88Q9H8K7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C10orf88Q9H8K7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C10orf88Q9H8K7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C10orf88Q9H8K7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C10orf88Q9H8K7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C10orf88Q9H8K7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C10orf88Q9H8K7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C10orf88Q9H8K7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C10orf88Q9H8K7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C10orf88Q9H8K7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C10orf88Q9H8K7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C10orf88Q9H8K7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C10orf88Q9H8K7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C10orf88Q9H8K7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C10orf88Q9H8K7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C10orf88Q9H8K7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C10orf88Q9H8K7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C10orf88Q9H8K7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C10orf88Q9H8K7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C10orf88Q9H8K7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
C10orf88Q9H8K7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C10orf88Q9H8K7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C10orf88Q9H8K7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C10orf88Q9H8K7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C10orf88Q9H8K7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C10orf88Q9H8K7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C10orf88Q9H8K7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C10orf88Q9H8K7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C10orf88Q9H8K7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C10orf88Q9H8K7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C10orf88Q9H8K7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C10orf88Q9H8K7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C10orf88Q9H8K7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C10orf88Q9H8K7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C10orf88Q9H8K7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C10orf88Q9H8K7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C10orf88Q9H8K7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
C10orf88Q9H8K7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C10orf88Q9H8K7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C10orf88Q9H8K7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C10orf88Q9H8K7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C10orf88Q9H8K7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C10orf88Q9H8K7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
C10orf88Q9H8K7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C10orf88Q9H8K7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C10orf88Q9H8K7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C10orf88Q9H8K7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C10orf88Q9H8K7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C10orf88Q9H8K7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C10orf88Q9H8K7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
C10orf88Q9H8K7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C10orf88Q9H8K7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C10orf88Q9H8K7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C10orf88Q9H8K7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C10orf88Q9H8K7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C10orf88Q9H8K7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C10orf88Q9H8K7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C10orf88Q9H8K7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C10orf88Q9H8K7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C10orf88Q9H8K7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C10orf88Q9H8K7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C10orf88Q9H8K7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C10orf88Q9H8K7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C10orf88Q9H8K7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C10orf88Q9H8K7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C10orf88Q9H8K7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C10orf88Q9H8K7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C10orf88Q9H8K7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C10orf88Q9H8K7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C10orf88Q9H8K7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C10orf88Q9H8K7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms