Protein–RNA interactions for Protein: Q9H649

NSUN3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN3Q9H649 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NSUN3Q9H649 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NSUN3Q9H649 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NSUN3Q9H649 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NSUN3Q9H649 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSUN3Q9H649 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSUN3Q9H649 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSUN3Q9H649 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NSUN3Q9H649 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NSUN3Q9H649 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NSUN3Q9H649 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NSUN3Q9H649 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NSUN3Q9H649 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NSUN3Q9H649 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NSUN3Q9H649 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NSUN3Q9H649 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NSUN3Q9H649 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NSUN3Q9H649 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NSUN3Q9H649 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NSUN3Q9H649 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NSUN3Q9H649 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NSUN3Q9H649 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NSUN3Q9H649 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NSUN3Q9H649 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NSUN3Q9H649 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NSUN3Q9H649 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NSUN3Q9H649 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NSUN3Q9H649 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NSUN3Q9H649 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NSUN3Q9H649 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NSUN3Q9H649 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NSUN3Q9H649 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NSUN3Q9H649 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NSUN3Q9H649 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NSUN3Q9H649 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NSUN3Q9H649 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NSUN3Q9H649 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NSUN3Q9H649 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NSUN3Q9H649 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NSUN3Q9H649 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NSUN3Q9H649 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NSUN3Q9H649 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NSUN3Q9H649 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NSUN3Q9H649 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NSUN3Q9H649 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NSUN3Q9H649 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NSUN3Q9H649 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NSUN3Q9H649 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NSUN3Q9H649 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NSUN3Q9H649 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NSUN3Q9H649 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NSUN3Q9H649 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NSUN3Q9H649 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NSUN3Q9H649 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NSUN3Q9H649 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NSUN3Q9H649 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSUN3Q9H649 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSUN3Q9H649 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSUN3Q9H649 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSUN3Q9H649 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSUN3Q9H649 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NSUN3Q9H649 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NSUN3Q9H649 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NSUN3Q9H649 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NSUN3Q9H649 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSUN3Q9H649 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSUN3Q9H649 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSUN3Q9H649 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSUN3Q9H649 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSUN3Q9H649 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NSUN3Q9H649 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSUN3Q9H649 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSUN3Q9H649 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSUN3Q9H649 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSUN3Q9H649 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NSUN3Q9H649 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NSUN3Q9H649 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NSUN3Q9H649 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NSUN3Q9H649 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NSUN3Q9H649 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NSUN3Q9H649 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NSUN3Q9H649 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NSUN3Q9H649 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NSUN3Q9H649 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NSUN3Q9H649 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NSUN3Q9H649 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSUN3Q9H649 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSUN3Q9H649 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSUN3Q9H649 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSUN3Q9H649 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NSUN3Q9H649 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSUN3Q9H649 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSUN3Q9H649 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSUN3Q9H649 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NSUN3Q9H649 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NSUN3Q9H649 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NSUN3Q9H649 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NSUN3Q9H649 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NSUN3Q9H649 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NSUN3Q9H649 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms