Protein–RNA interactions for Protein: Q9H040

SPRTN, SprT-like domain-containing protein Spartan, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRTNQ9H040 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPRTNQ9H040 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPRTNQ9H040 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPRTNQ9H040 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPRTNQ9H040 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPRTNQ9H040 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPRTNQ9H040 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPRTNQ9H040 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPRTNQ9H040 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPRTNQ9H040 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPRTNQ9H040 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPRTNQ9H040 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPRTNQ9H040 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SPRTNQ9H040 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPRTNQ9H040 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPRTNQ9H040 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPRTNQ9H040 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPRTNQ9H040 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPRTNQ9H040 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPRTNQ9H040 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPRTNQ9H040 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPRTNQ9H040 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPRTNQ9H040 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPRTNQ9H040 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPRTNQ9H040 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPRTNQ9H040 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPRTNQ9H040 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPRTNQ9H040 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPRTNQ9H040 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPRTNQ9H040 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPRTNQ9H040 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPRTNQ9H040 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPRTNQ9H040 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPRTNQ9H040 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPRTNQ9H040 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPRTNQ9H040 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPRTNQ9H040 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SPRTNQ9H040 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPRTNQ9H040 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPRTNQ9H040 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPRTNQ9H040 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPRTNQ9H040 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPRTNQ9H040 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPRTNQ9H040 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPRTNQ9H040 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SPRTNQ9H040 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPRTNQ9H040 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPRTNQ9H040 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPRTNQ9H040 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPRTNQ9H040 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPRTNQ9H040 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPRTNQ9H040 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPRTNQ9H040 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPRTNQ9H040 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPRTNQ9H040 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPRTNQ9H040 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPRTNQ9H040 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPRTNQ9H040 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPRTNQ9H040 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPRTNQ9H040 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SPRTNQ9H040 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPRTNQ9H040 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SPRTNQ9H040 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPRTNQ9H040 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPRTNQ9H040 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPRTNQ9H040 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPRTNQ9H040 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPRTNQ9H040 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPRTNQ9H040 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPRTNQ9H040 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPRTNQ9H040 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPRTNQ9H040 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPRTNQ9H040 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPRTNQ9H040 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPRTNQ9H040 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPRTNQ9H040 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPRTNQ9H040 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPRTNQ9H040 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPRTNQ9H040 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPRTNQ9H040 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPRTNQ9H040 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPRTNQ9H040 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPRTNQ9H040 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPRTNQ9H040 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPRTNQ9H040 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPRTNQ9H040 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPRTNQ9H040 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPRTNQ9H040 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPRTNQ9H040 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPRTNQ9H040 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPRTNQ9H040 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPRTNQ9H040 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPRTNQ9H040 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPRTNQ9H040 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPRTNQ9H040 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPRTNQ9H040 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPRTNQ9H040 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPRTNQ9H040 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SPRTNQ9H040 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPRTNQ9H040 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 855.5 ms