Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL4Q9C0H6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL4Q9C0H6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL4Q9C0H6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL4Q9C0H6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL4Q9C0H6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL4Q9C0H6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL4Q9C0H6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL4Q9C0H6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL4Q9C0H6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL4Q9C0H6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL4Q9C0H6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL4Q9C0H6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL4Q9C0H6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL4Q9C0H6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL4Q9C0H6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL4Q9C0H6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL4Q9C0H6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL4Q9C0H6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL4Q9C0H6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL4Q9C0H6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL4Q9C0H6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL4Q9C0H6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL4Q9C0H6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL4Q9C0H6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL4Q9C0H6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL4Q9C0H6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL4Q9C0H6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL4Q9C0H6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL4Q9C0H6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL4Q9C0H6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL4Q9C0H6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL4Q9C0H6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL4Q9C0H6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL4Q9C0H6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL4Q9C0H6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL4Q9C0H6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL4Q9C0H6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL4Q9C0H6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL4Q9C0H6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL4Q9C0H6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL4Q9C0H6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL4Q9C0H6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL4Q9C0H6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KLHL4Q9C0H6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL4Q9C0H6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL4Q9C0H6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL4Q9C0H6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL4Q9C0H6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL4Q9C0H6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL4Q9C0H6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL4Q9C0H6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL4Q9C0H6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL4Q9C0H6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL4Q9C0H6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL4Q9C0H6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL4Q9C0H6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL4Q9C0H6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL4Q9C0H6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL4Q9C0H6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL4Q9C0H6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL4Q9C0H6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL4Q9C0H6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL4Q9C0H6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL4Q9C0H6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL4Q9C0H6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL4Q9C0H6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL4Q9C0H6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL4Q9C0H6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL4Q9C0H6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KLHL4Q9C0H6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL4Q9C0H6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL4Q9C0H6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL4Q9C0H6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL4Q9C0H6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL4Q9C0H6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL4Q9C0H6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL4Q9C0H6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL4Q9C0H6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL4Q9C0H6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL4Q9C0H6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL4Q9C0H6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL4Q9C0H6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL4Q9C0H6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL4Q9C0H6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL4Q9C0H6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL4Q9C0H6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL4Q9C0H6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL4Q9C0H6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL4Q9C0H6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL4Q9C0H6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL4Q9C0H6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL4Q9C0H6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL4Q9C0H6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL4Q9C0H6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL4Q9C0H6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL4Q9C0H6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL4Q9C0H6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL4Q9C0H6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL4Q9C0H6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms