Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXU9

CALN1, Calcium-binding protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALN1Q9BXU9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CALN1Q9BXU9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CALN1Q9BXU9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CALN1Q9BXU9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CALN1Q9BXU9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CALN1Q9BXU9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CALN1Q9BXU9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CALN1Q9BXU9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CALN1Q9BXU9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CALN1Q9BXU9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CALN1Q9BXU9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CALN1Q9BXU9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CALN1Q9BXU9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CALN1Q9BXU9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CALN1Q9BXU9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CALN1Q9BXU9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CALN1Q9BXU9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CALN1Q9BXU9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CALN1Q9BXU9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CALN1Q9BXU9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CALN1Q9BXU9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CALN1Q9BXU9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CALN1Q9BXU9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CALN1Q9BXU9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CALN1Q9BXU9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CALN1Q9BXU9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CALN1Q9BXU9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CALN1Q9BXU9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CALN1Q9BXU9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CALN1Q9BXU9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CALN1Q9BXU9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CALN1Q9BXU9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CALN1Q9BXU9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CALN1Q9BXU9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CALN1Q9BXU9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CALN1Q9BXU9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CALN1Q9BXU9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CALN1Q9BXU9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CALN1Q9BXU9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CALN1Q9BXU9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CALN1Q9BXU9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CALN1Q9BXU9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CALN1Q9BXU9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CALN1Q9BXU9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CALN1Q9BXU9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CALN1Q9BXU9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CALN1Q9BXU9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CALN1Q9BXU9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CALN1Q9BXU9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CALN1Q9BXU9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CALN1Q9BXU9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CALN1Q9BXU9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CALN1Q9BXU9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CALN1Q9BXU9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CALN1Q9BXU9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CALN1Q9BXU9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CALN1Q9BXU9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CALN1Q9BXU9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CALN1Q9BXU9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CALN1Q9BXU9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CALN1Q9BXU9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CALN1Q9BXU9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALN1Q9BXU9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALN1Q9BXU9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALN1Q9BXU9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALN1Q9BXU9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALN1Q9BXU9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALN1Q9BXU9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CALN1Q9BXU9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALN1Q9BXU9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CALN1Q9BXU9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CALN1Q9BXU9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CALN1Q9BXU9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CALN1Q9BXU9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CALN1Q9BXU9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CALN1Q9BXU9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CALN1Q9BXU9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CALN1Q9BXU9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CALN1Q9BXU9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CALN1Q9BXU9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CALN1Q9BXU9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CALN1Q9BXU9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CALN1Q9BXU9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CALN1Q9BXU9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CALN1Q9BXU9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CALN1Q9BXU9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CALN1Q9BXU9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CALN1Q9BXU9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CALN1Q9BXU9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CALN1Q9BXU9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CALN1Q9BXU9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CALN1Q9BXU9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CALN1Q9BXU9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CALN1Q9BXU9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CALN1Q9BXU9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CALN1Q9BXU9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALN1Q9BXU9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALN1Q9BXU9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALN1Q9BXU9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALN1Q9BXU9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms