Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNG6Q9BXT2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNG6Q9BXT2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNG6Q9BXT2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNG6Q9BXT2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNG6Q9BXT2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNG6Q9BXT2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNG6Q9BXT2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNG6Q9BXT2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNG6Q9BXT2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNG6Q9BXT2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNG6Q9BXT2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNG6Q9BXT2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNG6Q9BXT2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNG6Q9BXT2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNG6Q9BXT2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNG6Q9BXT2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNG6Q9BXT2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNG6Q9BXT2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNG6Q9BXT2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNG6Q9BXT2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNG6Q9BXT2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNG6Q9BXT2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNG6Q9BXT2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNG6Q9BXT2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNG6Q9BXT2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNG6Q9BXT2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNG6Q9BXT2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNG6Q9BXT2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNG6Q9BXT2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNG6Q9BXT2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNG6Q9BXT2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNG6Q9BXT2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNG6Q9BXT2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNG6Q9BXT2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNG6Q9BXT2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNG6Q9BXT2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNG6Q9BXT2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNG6Q9BXT2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNG6Q9BXT2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNG6Q9BXT2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNG6Q9BXT2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNG6Q9BXT2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNG6Q9BXT2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNG6Q9BXT2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG6Q9BXT2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG6Q9BXT2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG6Q9BXT2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG6Q9BXT2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG6Q9BXT2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG6Q9BXT2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG6Q9BXT2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG6Q9BXT2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG6Q9BXT2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG6Q9BXT2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNG6Q9BXT2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNG6Q9BXT2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNG6Q9BXT2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNG6Q9BXT2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNG6Q9BXT2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNG6Q9BXT2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNG6Q9BXT2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNG6Q9BXT2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNG6Q9BXT2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG6Q9BXT2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG6Q9BXT2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG6Q9BXT2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG6Q9BXT2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG6Q9BXT2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNG6Q9BXT2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNG6Q9BXT2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNG6Q9BXT2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNG6Q9BXT2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNG6Q9BXT2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNG6Q9BXT2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNG6Q9BXT2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNG6Q9BXT2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNG6Q9BXT2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNG6Q9BXT2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNG6Q9BXT2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNG6Q9BXT2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNG6Q9BXT2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNG6Q9BXT2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNG6Q9BXT2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNG6Q9BXT2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNG6Q9BXT2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNG6Q9BXT2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNG6Q9BXT2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNG6Q9BXT2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNG6Q9BXT2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNG6Q9BXT2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNG6Q9BXT2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNG6Q9BXT2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNG6Q9BXT2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNG6Q9BXT2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNG6Q9BXT2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNG6Q9BXT2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNG6Q9BXT2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNG6Q9BXT2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNG6Q9BXT2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms