Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
BRIP1Q9BX63 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
BRIP1Q9BX63 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
BRIP1Q9BX63 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
BRIP1Q9BX63 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
BRIP1Q9BX63 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
BRIP1Q9BX63 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
BRIP1Q9BX63 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
BRIP1Q9BX63 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
BRIP1Q9BX63 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
BRIP1Q9BX63 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
BRIP1Q9BX63 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
BRIP1Q9BX63 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
BRIP1Q9BX63 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
BRIP1Q9BX63 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
BRIP1Q9BX63 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
BRIP1Q9BX63 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
BRIP1Q9BX63 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
BRIP1Q9BX63 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
BRIP1Q9BX63 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
BRIP1Q9BX63 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
BRIP1Q9BX63 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
BRIP1Q9BX63 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
BRIP1Q9BX63 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
BRIP1Q9BX63 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
BRIP1Q9BX63 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
BRIP1Q9BX63 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
BRIP1Q9BX63 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
BRIP1Q9BX63 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
BRIP1Q9BX63 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
BRIP1Q9BX63 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
BRIP1Q9BX63 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
BRIP1Q9BX63 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
BRIP1Q9BX63 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
BRIP1Q9BX63 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
BRIP1Q9BX63 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
BRIP1Q9BX63 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
BRIP1Q9BX63 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
BRIP1Q9BX63 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
BRIP1Q9BX63 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
BRIP1Q9BX63 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
BRIP1Q9BX63 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.95■■■□□ 2.7
BRIP1Q9BX63 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
BRIP1Q9BX63 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
BRIP1Q9BX63 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
BRIP1Q9BX63 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
BRIP1Q9BX63 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
BRIP1Q9BX63 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
BRIP1Q9BX63 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
BRIP1Q9BX63 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
BRIP1Q9BX63 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
BRIP1Q9BX63 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
BRIP1Q9BX63 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
BRIP1Q9BX63 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
BRIP1Q9BX63 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
BRIP1Q9BX63 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
BRIP1Q9BX63 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
BRIP1Q9BX63 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
BRIP1Q9BX63 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
BRIP1Q9BX63 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
BRIP1Q9BX63 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
BRIP1Q9BX63 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
BRIP1Q9BX63 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
BRIP1Q9BX63 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
BRIP1Q9BX63 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
BRIP1Q9BX63 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
BRIP1Q9BX63 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
BRIP1Q9BX63 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
BRIP1Q9BX63 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
BRIP1Q9BX63 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC31.86■■■□□ 2.69
BRIP1Q9BX63 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
BRIP1Q9BX63 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
BRIP1Q9BX63 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
BRIP1Q9BX63 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
BRIP1Q9BX63 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
BRIP1Q9BX63 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
BRIP1Q9BX63 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
BRIP1Q9BX63 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
BRIP1Q9BX63 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
BRIP1Q9BX63 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
BRIP1Q9BX63 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
BRIP1Q9BX63 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
BRIP1Q9BX63 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
BRIP1Q9BX63 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
BRIP1Q9BX63 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
BRIP1Q9BX63 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
BRIP1Q9BX63 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
BRIP1Q9BX63 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
BRIP1Q9BX63 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
BRIP1Q9BX63 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
BRIP1Q9BX63 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
BRIP1Q9BX63 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
BRIP1Q9BX63 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
BRIP1Q9BX63 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
BRIP1Q9BX63 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
BRIP1Q9BX63 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
BRIP1Q9BX63 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
BRIP1Q9BX63 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
BRIP1Q9BX63 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
BRIP1Q9BX63 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms