Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBA1CQ9BQE3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBA1CQ9BQE3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBA1CQ9BQE3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBA1CQ9BQE3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBA1CQ9BQE3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBA1CQ9BQE3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBA1CQ9BQE3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBA1CQ9BQE3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBA1CQ9BQE3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBA1CQ9BQE3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBA1CQ9BQE3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBA1CQ9BQE3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBA1CQ9BQE3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBA1CQ9BQE3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBA1CQ9BQE3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBA1CQ9BQE3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBA1CQ9BQE3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBA1CQ9BQE3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBA1CQ9BQE3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBA1CQ9BQE3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBA1CQ9BQE3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBA1CQ9BQE3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBA1CQ9BQE3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBA1CQ9BQE3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBA1CQ9BQE3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBA1CQ9BQE3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBA1CQ9BQE3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBA1CQ9BQE3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBA1CQ9BQE3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBA1CQ9BQE3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBA1CQ9BQE3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBA1CQ9BQE3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBA1CQ9BQE3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBA1CQ9BQE3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBA1CQ9BQE3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBA1CQ9BQE3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBA1CQ9BQE3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBA1CQ9BQE3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBA1CQ9BQE3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBA1CQ9BQE3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBA1CQ9BQE3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBA1CQ9BQE3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBA1CQ9BQE3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBA1CQ9BQE3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBA1CQ9BQE3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBA1CQ9BQE3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBA1CQ9BQE3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBA1CQ9BQE3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBA1CQ9BQE3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBA1CQ9BQE3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBA1CQ9BQE3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBA1CQ9BQE3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBA1CQ9BQE3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBA1CQ9BQE3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBA1CQ9BQE3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBA1CQ9BQE3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBA1CQ9BQE3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBA1CQ9BQE3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBA1CQ9BQE3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBA1CQ9BQE3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBA1CQ9BQE3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBA1CQ9BQE3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBA1CQ9BQE3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBA1CQ9BQE3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBA1CQ9BQE3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBA1CQ9BQE3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBA1CQ9BQE3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBA1CQ9BQE3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBA1CQ9BQE3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBA1CQ9BQE3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBA1CQ9BQE3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBA1CQ9BQE3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBA1CQ9BQE3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBA1CQ9BQE3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBA1CQ9BQE3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBA1CQ9BQE3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBA1CQ9BQE3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBA1CQ9BQE3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBA1CQ9BQE3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBA1CQ9BQE3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBA1CQ9BQE3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBA1CQ9BQE3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBA1CQ9BQE3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBA1CQ9BQE3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBA1CQ9BQE3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBA1CQ9BQE3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBA1CQ9BQE3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBA1CQ9BQE3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBA1CQ9BQE3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBA1CQ9BQE3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBA1CQ9BQE3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBA1CQ9BQE3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBA1CQ9BQE3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBA1CQ9BQE3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBA1CQ9BQE3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBA1CQ9BQE3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBA1CQ9BQE3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBA1CQ9BQE3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBA1CQ9BQE3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.1 ms