Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ04

RBM4B, RNA-binding protein 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4BQ9BQ04 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBM4BQ9BQ04 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBM4BQ9BQ04 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM4BQ9BQ04 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM4BQ9BQ04 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM4BQ9BQ04 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM4BQ9BQ04 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM4BQ9BQ04 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM4BQ9BQ04 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM4BQ9BQ04 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM4BQ9BQ04 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM4BQ9BQ04 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM4BQ9BQ04 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM4BQ9BQ04 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM4BQ9BQ04 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM4BQ9BQ04 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM4BQ9BQ04 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM4BQ9BQ04 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM4BQ9BQ04 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM4BQ9BQ04 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM4BQ9BQ04 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM4BQ9BQ04 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM4BQ9BQ04 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RBM4BQ9BQ04 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
RBM4BQ9BQ04 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
RBM4BQ9BQ04 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBM4BQ9BQ04 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBM4BQ9BQ04 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBM4BQ9BQ04 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM4BQ9BQ04 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM4BQ9BQ04 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM4BQ9BQ04 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM4BQ9BQ04 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM4BQ9BQ04 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM4BQ9BQ04 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM4BQ9BQ04 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM4BQ9BQ04 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM4BQ9BQ04 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM4BQ9BQ04 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM4BQ9BQ04 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM4BQ9BQ04 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM4BQ9BQ04 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM4BQ9BQ04 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM4BQ9BQ04 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM4BQ9BQ04 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBM4BQ9BQ04 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBM4BQ9BQ04 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RBM4BQ9BQ04 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBM4BQ9BQ04 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBM4BQ9BQ04 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBM4BQ9BQ04 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBM4BQ9BQ04 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBM4BQ9BQ04 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM4BQ9BQ04 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM4BQ9BQ04 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM4BQ9BQ04 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM4BQ9BQ04 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM4BQ9BQ04 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM4BQ9BQ04 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM4BQ9BQ04 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM4BQ9BQ04 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM4BQ9BQ04 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM4BQ9BQ04 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBM4BQ9BQ04 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBM4BQ9BQ04 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBM4BQ9BQ04 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBM4BQ9BQ04 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBM4BQ9BQ04 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBM4BQ9BQ04 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBM4BQ9BQ04 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBM4BQ9BQ04 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM4BQ9BQ04 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM4BQ9BQ04 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM4BQ9BQ04 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM4BQ9BQ04 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM4BQ9BQ04 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM4BQ9BQ04 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM4BQ9BQ04 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM4BQ9BQ04 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM4BQ9BQ04 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM4BQ9BQ04 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM4BQ9BQ04 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM4BQ9BQ04 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM4BQ9BQ04 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM4BQ9BQ04 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM4BQ9BQ04 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM4BQ9BQ04 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM4BQ9BQ04 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM4BQ9BQ04 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM4BQ9BQ04 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM4BQ9BQ04 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM4BQ9BQ04 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM4BQ9BQ04 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM4BQ9BQ04 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBM4BQ9BQ04 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM4BQ9BQ04 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM4BQ9BQ04 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM4BQ9BQ04 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM4BQ9BQ04 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RBM4BQ9BQ04 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms