Protein–RNA interactions for Protein: Q99996

AKAP9, A-kinase anchor protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 3,911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP9Q99996 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
AKAP9Q99996 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AKAP9Q99996 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AKAP9Q99996 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AKAP9Q99996 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AKAP9Q99996 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
AKAP9Q99996 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AKAP9Q99996 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AKAP9Q99996 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
AKAP9Q99996 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AKAP9Q99996 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
AKAP9Q99996 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AKAP9Q99996 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AKAP9Q99996 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
AKAP9Q99996 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AKAP9Q99996 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AKAP9Q99996 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AKAP9Q99996 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AKAP9Q99996 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AKAP9Q99996 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AKAP9Q99996 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AKAP9Q99996 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AKAP9Q99996 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AKAP9Q99996 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AKAP9Q99996 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AKAP9Q99996 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AKAP9Q99996 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
AKAP9Q99996 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AKAP9Q99996 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AKAP9Q99996 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AKAP9Q99996 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AKAP9Q99996 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
AKAP9Q99996 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AKAP9Q99996 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AKAP9Q99996 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
AKAP9Q99996 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AKAP9Q99996 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AKAP9Q99996 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AKAP9Q99996 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AKAP9Q99996 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AKAP9Q99996 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AKAP9Q99996 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AKAP9Q99996 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AKAP9Q99996 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AKAP9Q99996 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AKAP9Q99996 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AKAP9Q99996 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AKAP9Q99996 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AKAP9Q99996 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AKAP9Q99996 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AKAP9Q99996 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
AKAP9Q99996 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
AKAP9Q99996 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
AKAP9Q99996 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AKAP9Q99996 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
AKAP9Q99996 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
AKAP9Q99996 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
AKAP9Q99996 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
AKAP9Q99996 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AKAP9Q99996 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AKAP9Q99996 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AKAP9Q99996 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AKAP9Q99996 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AKAP9Q99996 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AKAP9Q99996 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AKAP9Q99996 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AKAP9Q99996 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
AKAP9Q99996 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AKAP9Q99996 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AKAP9Q99996 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AKAP9Q99996 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AKAP9Q99996 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AKAP9Q99996 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AKAP9Q99996 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
AKAP9Q99996 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AKAP9Q99996 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AKAP9Q99996 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AKAP9Q99996 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AKAP9Q99996 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AKAP9Q99996 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AKAP9Q99996 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AKAP9Q99996 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AKAP9Q99996 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AKAP9Q99996 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AKAP9Q99996 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AKAP9Q99996 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AKAP9Q99996 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AKAP9Q99996 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AKAP9Q99996 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AKAP9Q99996 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AKAP9Q99996 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AKAP9Q99996 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AKAP9Q99996 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AKAP9Q99996 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AKAP9Q99996 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AKAP9Q99996 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AKAP9Q99996 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AKAP9Q99996 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AKAP9Q99996 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AKAP9Q99996 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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