Protein–RNA interactions for Protein: Q99643

SDHC, Succinate dehydrogenase cytochrome b560 subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHCQ99643 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDHCQ99643 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDHCQ99643 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDHCQ99643 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDHCQ99643 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDHCQ99643 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDHCQ99643 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDHCQ99643 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDHCQ99643 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDHCQ99643 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDHCQ99643 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDHCQ99643 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDHCQ99643 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDHCQ99643 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDHCQ99643 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDHCQ99643 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDHCQ99643 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHCQ99643 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHCQ99643 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHCQ99643 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHCQ99643 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHCQ99643 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHCQ99643 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHCQ99643 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHCQ99643 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHCQ99643 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHCQ99643 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHCQ99643 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHCQ99643 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHCQ99643 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHCQ99643 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHCQ99643 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHCQ99643 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SDHCQ99643 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SDHCQ99643 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SDHCQ99643 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHCQ99643 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHCQ99643 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHCQ99643 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDHCQ99643 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDHCQ99643 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDHCQ99643 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDHCQ99643 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDHCQ99643 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDHCQ99643 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDHCQ99643 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDHCQ99643 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDHCQ99643 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDHCQ99643 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDHCQ99643 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDHCQ99643 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDHCQ99643 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDHCQ99643 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDHCQ99643 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDHCQ99643 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDHCQ99643 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDHCQ99643 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDHCQ99643 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SDHCQ99643 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDHCQ99643 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDHCQ99643 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDHCQ99643 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDHCQ99643 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDHCQ99643 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDHCQ99643 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDHCQ99643 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SDHCQ99643 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SDHCQ99643 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDHCQ99643 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDHCQ99643 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDHCQ99643 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDHCQ99643 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDHCQ99643 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDHCQ99643 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDHCQ99643 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDHCQ99643 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDHCQ99643 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDHCQ99643 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDHCQ99643 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDHCQ99643 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDHCQ99643 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SDHCQ99643 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SDHCQ99643 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SDHCQ99643 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDHCQ99643 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDHCQ99643 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDHCQ99643 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDHCQ99643 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDHCQ99643 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDHCQ99643 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDHCQ99643 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDHCQ99643 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDHCQ99643 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDHCQ99643 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDHCQ99643 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDHCQ99643 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDHCQ99643 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDHCQ99643 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDHCQ99643 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDHCQ99643 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms