Protein–RNA interactions for Protein: Q99614

TTC1, Tetratricopeptide repeat protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC1Q99614 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC1Q99614 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC1Q99614 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC1Q99614 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC1Q99614 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC1Q99614 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC1Q99614 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC1Q99614 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TTC1Q99614 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TTC1Q99614 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC1Q99614 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC1Q99614 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC1Q99614 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC1Q99614 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC1Q99614 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC1Q99614 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC1Q99614 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTC1Q99614 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTC1Q99614 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTC1Q99614 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTC1Q99614 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC1Q99614 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC1Q99614 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC1Q99614 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC1Q99614 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC1Q99614 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC1Q99614 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC1Q99614 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC1Q99614 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC1Q99614 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC1Q99614 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC1Q99614 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC1Q99614 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC1Q99614 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC1Q99614 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC1Q99614 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC1Q99614 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC1Q99614 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC1Q99614 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC1Q99614 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC1Q99614 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC1Q99614 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC1Q99614 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC1Q99614 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC1Q99614 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC1Q99614 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC1Q99614 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC1Q99614 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
TTC1Q99614 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TTC1Q99614 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC1Q99614 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC1Q99614 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC1Q99614 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC1Q99614 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC1Q99614 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC1Q99614 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC1Q99614 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC1Q99614 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC1Q99614 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC1Q99614 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC1Q99614 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC1Q99614 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC1Q99614 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC1Q99614 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC1Q99614 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC1Q99614 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC1Q99614 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC1Q99614 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC1Q99614 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTC1Q99614 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTC1Q99614 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTC1Q99614 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTC1Q99614 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTC1Q99614 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTC1Q99614 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTC1Q99614 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTC1Q99614 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC1Q99614 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC1Q99614 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC1Q99614 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC1Q99614 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC1Q99614 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC1Q99614 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC1Q99614 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC1Q99614 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC1Q99614 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC1Q99614 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC1Q99614 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC1Q99614 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC1Q99614 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC1Q99614 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC1Q99614 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC1Q99614 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC1Q99614 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC1Q99614 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC1Q99614 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC1Q99614 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC1Q99614 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC1Q99614 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC1Q99614 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.2 ms