Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBGCP5Q96RT8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBGCP5Q96RT8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBGCP5Q96RT8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBGCP5Q96RT8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBGCP5Q96RT8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBGCP5Q96RT8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBGCP5Q96RT8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBGCP5Q96RT8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TUBGCP5Q96RT8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBGCP5Q96RT8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBGCP5Q96RT8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBGCP5Q96RT8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBGCP5Q96RT8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBGCP5Q96RT8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBGCP5Q96RT8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBGCP5Q96RT8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBGCP5Q96RT8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBGCP5Q96RT8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBGCP5Q96RT8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBGCP5Q96RT8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBGCP5Q96RT8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBGCP5Q96RT8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBGCP5Q96RT8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBGCP5Q96RT8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBGCP5Q96RT8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBGCP5Q96RT8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBGCP5Q96RT8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBGCP5Q96RT8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBGCP5Q96RT8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBGCP5Q96RT8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBGCP5Q96RT8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBGCP5Q96RT8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBGCP5Q96RT8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBGCP5Q96RT8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBGCP5Q96RT8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBGCP5Q96RT8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBGCP5Q96RT8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBGCP5Q96RT8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBGCP5Q96RT8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBGCP5Q96RT8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBGCP5Q96RT8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBGCP5Q96RT8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBGCP5Q96RT8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBGCP5Q96RT8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBGCP5Q96RT8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBGCP5Q96RT8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBGCP5Q96RT8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBGCP5Q96RT8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBGCP5Q96RT8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBGCP5Q96RT8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBGCP5Q96RT8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBGCP5Q96RT8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBGCP5Q96RT8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBGCP5Q96RT8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TUBGCP5Q96RT8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBGCP5Q96RT8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBGCP5Q96RT8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBGCP5Q96RT8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBGCP5Q96RT8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBGCP5Q96RT8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBGCP5Q96RT8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBGCP5Q96RT8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBGCP5Q96RT8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBGCP5Q96RT8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBGCP5Q96RT8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBGCP5Q96RT8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBGCP5Q96RT8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBGCP5Q96RT8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBGCP5Q96RT8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBGCP5Q96RT8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBGCP5Q96RT8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBGCP5Q96RT8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBGCP5Q96RT8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBGCP5Q96RT8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBGCP5Q96RT8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBGCP5Q96RT8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBGCP5Q96RT8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBGCP5Q96RT8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBGCP5Q96RT8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBGCP5Q96RT8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBGCP5Q96RT8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TUBGCP5Q96RT8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TUBGCP5Q96RT8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TUBGCP5Q96RT8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TUBGCP5Q96RT8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TUBGCP5Q96RT8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TUBGCP5Q96RT8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TUBGCP5Q96RT8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBGCP5Q96RT8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBGCP5Q96RT8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBGCP5Q96RT8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBGCP5Q96RT8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBGCP5Q96RT8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBGCP5Q96RT8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBGCP5Q96RT8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBGCP5Q96RT8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBGCP5Q96RT8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBGCP5Q96RT8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBGCP5Q96RT8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms