Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT6

CTAGE1, cTAGE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE1Q96RT6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTAGE1Q96RT6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTAGE1Q96RT6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTAGE1Q96RT6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CTAGE1Q96RT6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CTAGE1Q96RT6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CTAGE1Q96RT6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CTAGE1Q96RT6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CTAGE1Q96RT6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTAGE1Q96RT6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CTAGE1Q96RT6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTAGE1Q96RT6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTAGE1Q96RT6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTAGE1Q96RT6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTAGE1Q96RT6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTAGE1Q96RT6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTAGE1Q96RT6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTAGE1Q96RT6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTAGE1Q96RT6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTAGE1Q96RT6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTAGE1Q96RT6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTAGE1Q96RT6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTAGE1Q96RT6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTAGE1Q96RT6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTAGE1Q96RT6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTAGE1Q96RT6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTAGE1Q96RT6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTAGE1Q96RT6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTAGE1Q96RT6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTAGE1Q96RT6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CTAGE1Q96RT6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CTAGE1Q96RT6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CTAGE1Q96RT6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CTAGE1Q96RT6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CTAGE1Q96RT6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTAGE1Q96RT6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTAGE1Q96RT6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTAGE1Q96RT6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTAGE1Q96RT6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTAGE1Q96RT6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTAGE1Q96RT6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTAGE1Q96RT6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTAGE1Q96RT6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTAGE1Q96RT6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTAGE1Q96RT6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTAGE1Q96RT6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTAGE1Q96RT6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTAGE1Q96RT6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTAGE1Q96RT6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTAGE1Q96RT6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CTAGE1Q96RT6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CTAGE1Q96RT6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTAGE1Q96RT6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTAGE1Q96RT6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CTAGE1Q96RT6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTAGE1Q96RT6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTAGE1Q96RT6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTAGE1Q96RT6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTAGE1Q96RT6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CTAGE1Q96RT6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTAGE1Q96RT6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTAGE1Q96RT6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTAGE1Q96RT6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTAGE1Q96RT6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTAGE1Q96RT6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTAGE1Q96RT6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTAGE1Q96RT6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTAGE1Q96RT6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTAGE1Q96RT6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTAGE1Q96RT6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTAGE1Q96RT6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTAGE1Q96RT6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTAGE1Q96RT6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTAGE1Q96RT6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CTAGE1Q96RT6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTAGE1Q96RT6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTAGE1Q96RT6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTAGE1Q96RT6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTAGE1Q96RT6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTAGE1Q96RT6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTAGE1Q96RT6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CTAGE1Q96RT6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTAGE1Q96RT6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTAGE1Q96RT6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTAGE1Q96RT6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTAGE1Q96RT6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTAGE1Q96RT6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTAGE1Q96RT6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CTAGE1Q96RT6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CTAGE1Q96RT6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CTAGE1Q96RT6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CTAGE1Q96RT6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CTAGE1Q96RT6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CTAGE1Q96RT6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CTAGE1Q96RT6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CTAGE1Q96RT6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CTAGE1Q96RT6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTAGE1Q96RT6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTAGE1Q96RT6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTAGE1Q96RT6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms