Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP8

GBP5, Guanylate-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP5Q96PP8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBP5Q96PP8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GBP5Q96PP8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GBP5Q96PP8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GBP5Q96PP8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GBP5Q96PP8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GBP5Q96PP8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GBP5Q96PP8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GBP5Q96PP8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GBP5Q96PP8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GBP5Q96PP8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GBP5Q96PP8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GBP5Q96PP8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GBP5Q96PP8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GBP5Q96PP8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GBP5Q96PP8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GBP5Q96PP8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GBP5Q96PP8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GBP5Q96PP8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GBP5Q96PP8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GBP5Q96PP8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GBP5Q96PP8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GBP5Q96PP8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GBP5Q96PP8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GBP5Q96PP8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GBP5Q96PP8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GBP5Q96PP8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GBP5Q96PP8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GBP5Q96PP8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBP5Q96PP8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBP5Q96PP8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBP5Q96PP8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBP5Q96PP8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBP5Q96PP8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GBP5Q96PP8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GBP5Q96PP8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GBP5Q96PP8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GBP5Q96PP8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GBP5Q96PP8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GBP5Q96PP8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GBP5Q96PP8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GBP5Q96PP8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GBP5Q96PP8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GBP5Q96PP8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GBP5Q96PP8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GBP5Q96PP8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GBP5Q96PP8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GBP5Q96PP8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GBP5Q96PP8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GBP5Q96PP8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GBP5Q96PP8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GBP5Q96PP8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GBP5Q96PP8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBP5Q96PP8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBP5Q96PP8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GBP5Q96PP8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBP5Q96PP8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBP5Q96PP8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GBP5Q96PP8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GBP5Q96PP8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GBP5Q96PP8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GBP5Q96PP8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GBP5Q96PP8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GBP5Q96PP8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GBP5Q96PP8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GBP5Q96PP8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GBP5Q96PP8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GBP5Q96PP8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GBP5Q96PP8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GBP5Q96PP8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBP5Q96PP8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBP5Q96PP8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBP5Q96PP8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBP5Q96PP8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GBP5Q96PP8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GBP5Q96PP8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GBP5Q96PP8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GBP5Q96PP8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GBP5Q96PP8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GBP5Q96PP8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GBP5Q96PP8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GBP5Q96PP8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GBP5Q96PP8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GBP5Q96PP8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GBP5Q96PP8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBP5Q96PP8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBP5Q96PP8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBP5Q96PP8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBP5Q96PP8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP5Q96PP8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP5Q96PP8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP5Q96PP8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP5Q96PP8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GBP5Q96PP8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GBP5Q96PP8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GBP5Q96PP8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GBP5Q96PP8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GBP5Q96PP8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GBP5Q96PP8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GBP5Q96PP8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms