Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL1

TMEM74, Transmembrane protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM74Q96NL1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM74Q96NL1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM74Q96NL1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM74Q96NL1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM74Q96NL1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM74Q96NL1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM74Q96NL1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM74Q96NL1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM74Q96NL1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM74Q96NL1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM74Q96NL1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM74Q96NL1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM74Q96NL1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM74Q96NL1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM74Q96NL1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM74Q96NL1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM74Q96NL1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM74Q96NL1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM74Q96NL1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM74Q96NL1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM74Q96NL1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM74Q96NL1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM74Q96NL1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM74Q96NL1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM74Q96NL1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM74Q96NL1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM74Q96NL1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM74Q96NL1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM74Q96NL1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM74Q96NL1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM74Q96NL1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM74Q96NL1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM74Q96NL1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM74Q96NL1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM74Q96NL1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM74Q96NL1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM74Q96NL1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM74Q96NL1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM74Q96NL1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TMEM74Q96NL1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM74Q96NL1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM74Q96NL1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM74Q96NL1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM74Q96NL1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM74Q96NL1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM74Q96NL1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM74Q96NL1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM74Q96NL1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM74Q96NL1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM74Q96NL1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM74Q96NL1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM74Q96NL1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM74Q96NL1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM74Q96NL1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM74Q96NL1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM74Q96NL1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM74Q96NL1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM74Q96NL1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM74Q96NL1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM74Q96NL1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM74Q96NL1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM74Q96NL1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM74Q96NL1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM74Q96NL1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM74Q96NL1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM74Q96NL1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM74Q96NL1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM74Q96NL1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM74Q96NL1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM74Q96NL1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM74Q96NL1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM74Q96NL1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM74Q96NL1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM74Q96NL1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM74Q96NL1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM74Q96NL1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM74Q96NL1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM74Q96NL1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM74Q96NL1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM74Q96NL1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM74Q96NL1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM74Q96NL1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM74Q96NL1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM74Q96NL1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM74Q96NL1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM74Q96NL1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM74Q96NL1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM74Q96NL1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM74Q96NL1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM74Q96NL1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM74Q96NL1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM74Q96NL1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM74Q96NL1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM74Q96NL1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM74Q96NL1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM74Q96NL1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
TMEM74Q96NL1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMEM74Q96NL1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM74Q96NL1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM74Q96NL1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms