Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C8orf49Q96NF6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C8orf49Q96NF6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C8orf49Q96NF6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C8orf49Q96NF6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C8orf49Q96NF6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C8orf49Q96NF6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C8orf49Q96NF6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
C8orf49Q96NF6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C8orf49Q96NF6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C8orf49Q96NF6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C8orf49Q96NF6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C8orf49Q96NF6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C8orf49Q96NF6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C8orf49Q96NF6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C8orf49Q96NF6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C8orf49Q96NF6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C8orf49Q96NF6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C8orf49Q96NF6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C8orf49Q96NF6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C8orf49Q96NF6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C8orf49Q96NF6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C8orf49Q96NF6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C8orf49Q96NF6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C8orf49Q96NF6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C8orf49Q96NF6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C8orf49Q96NF6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C8orf49Q96NF6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C8orf49Q96NF6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C8orf49Q96NF6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C8orf49Q96NF6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
C8orf49Q96NF6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C8orf49Q96NF6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C8orf49Q96NF6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C8orf49Q96NF6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C8orf49Q96NF6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C8orf49Q96NF6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C8orf49Q96NF6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C8orf49Q96NF6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C8orf49Q96NF6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
C8orf49Q96NF6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
C8orf49Q96NF6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C8orf49Q96NF6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C8orf49Q96NF6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C8orf49Q96NF6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C8orf49Q96NF6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C8orf49Q96NF6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C8orf49Q96NF6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C8orf49Q96NF6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C8orf49Q96NF6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C8orf49Q96NF6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C8orf49Q96NF6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C8orf49Q96NF6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C8orf49Q96NF6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C8orf49Q96NF6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C8orf49Q96NF6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C8orf49Q96NF6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C8orf49Q96NF6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C8orf49Q96NF6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C8orf49Q96NF6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C8orf49Q96NF6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C8orf49Q96NF6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C8orf49Q96NF6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
C8orf49Q96NF6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C8orf49Q96NF6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C8orf49Q96NF6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C8orf49Q96NF6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C8orf49Q96NF6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
C8orf49Q96NF6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C8orf49Q96NF6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C8orf49Q96NF6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C8orf49Q96NF6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
C8orf49Q96NF6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
C8orf49Q96NF6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
C8orf49Q96NF6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
C8orf49Q96NF6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
C8orf49Q96NF6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C8orf49Q96NF6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C8orf49Q96NF6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C8orf49Q96NF6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C8orf49Q96NF6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C8orf49Q96NF6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C8orf49Q96NF6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C8orf49Q96NF6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C8orf49Q96NF6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C8orf49Q96NF6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C8orf49Q96NF6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C8orf49Q96NF6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C8orf49Q96NF6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C8orf49Q96NF6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C8orf49Q96NF6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C8orf49Q96NF6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C8orf49Q96NF6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C8orf49Q96NF6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C8orf49Q96NF6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C8orf49Q96NF6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C8orf49Q96NF6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C8orf49Q96NF6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C8orf49Q96NF6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C8orf49Q96NF6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms