Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK2

RIPOR3, RIPOR family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPOR3Q96MK2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RIPOR3Q96MK2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RIPOR3Q96MK2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RIPOR3Q96MK2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RIPOR3Q96MK2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RIPOR3Q96MK2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RIPOR3Q96MK2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RIPOR3Q96MK2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RIPOR3Q96MK2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RIPOR3Q96MK2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RIPOR3Q96MK2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RIPOR3Q96MK2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RIPOR3Q96MK2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RIPOR3Q96MK2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIPOR3Q96MK2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIPOR3Q96MK2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIPOR3Q96MK2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIPOR3Q96MK2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIPOR3Q96MK2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIPOR3Q96MK2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIPOR3Q96MK2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RIPOR3Q96MK2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RIPOR3Q96MK2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RIPOR3Q96MK2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIPOR3Q96MK2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIPOR3Q96MK2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIPOR3Q96MK2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIPOR3Q96MK2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIPOR3Q96MK2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIPOR3Q96MK2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RIPOR3Q96MK2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RIPOR3Q96MK2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RIPOR3Q96MK2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RIPOR3Q96MK2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RIPOR3Q96MK2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RIPOR3Q96MK2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RIPOR3Q96MK2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RIPOR3Q96MK2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RIPOR3Q96MK2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RIPOR3Q96MK2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RIPOR3Q96MK2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RIPOR3Q96MK2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RIPOR3Q96MK2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RIPOR3Q96MK2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RIPOR3Q96MK2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RIPOR3Q96MK2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIPOR3Q96MK2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIPOR3Q96MK2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIPOR3Q96MK2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIPOR3Q96MK2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RIPOR3Q96MK2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RIPOR3Q96MK2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RIPOR3Q96MK2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RIPOR3Q96MK2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RIPOR3Q96MK2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RIPOR3Q96MK2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RIPOR3Q96MK2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RIPOR3Q96MK2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RIPOR3Q96MK2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RIPOR3Q96MK2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIPOR3Q96MK2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIPOR3Q96MK2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIPOR3Q96MK2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RIPOR3Q96MK2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RIPOR3Q96MK2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RIPOR3Q96MK2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIPOR3Q96MK2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIPOR3Q96MK2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIPOR3Q96MK2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RIPOR3Q96MK2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RIPOR3Q96MK2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RIPOR3Q96MK2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RIPOR3Q96MK2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RIPOR3Q96MK2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RIPOR3Q96MK2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIPOR3Q96MK2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RIPOR3Q96MK2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIPOR3Q96MK2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIPOR3Q96MK2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIPOR3Q96MK2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIPOR3Q96MK2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RIPOR3Q96MK2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIPOR3Q96MK2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIPOR3Q96MK2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RIPOR3Q96MK2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIPOR3Q96MK2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIPOR3Q96MK2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIPOR3Q96MK2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIPOR3Q96MK2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIPOR3Q96MK2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIPOR3Q96MK2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RIPOR3Q96MK2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RIPOR3Q96MK2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RIPOR3Q96MK2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RIPOR3Q96MK2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RIPOR3Q96MK2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RIPOR3Q96MK2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RIPOR3Q96MK2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RIPOR3Q96MK2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RIPOR3Q96MK2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms