Protein–RNA interactions for Protein: Q96HB5

CCDC120, Coiled-coil domain-containing protein 120, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC120Q96HB5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC120Q96HB5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC120Q96HB5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC120Q96HB5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC120Q96HB5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC120Q96HB5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC120Q96HB5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC120Q96HB5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC120Q96HB5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC120Q96HB5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC120Q96HB5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC120Q96HB5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC120Q96HB5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC120Q96HB5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC120Q96HB5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC120Q96HB5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC120Q96HB5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC120Q96HB5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC120Q96HB5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC120Q96HB5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC120Q96HB5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC120Q96HB5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC120Q96HB5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC120Q96HB5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC120Q96HB5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC120Q96HB5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC120Q96HB5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC120Q96HB5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC120Q96HB5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC120Q96HB5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC120Q96HB5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC120Q96HB5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC120Q96HB5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC120Q96HB5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC120Q96HB5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC120Q96HB5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC120Q96HB5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC120Q96HB5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC120Q96HB5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC120Q96HB5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC120Q96HB5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC120Q96HB5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC120Q96HB5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC120Q96HB5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC120Q96HB5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC120Q96HB5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC120Q96HB5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC120Q96HB5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC120Q96HB5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC120Q96HB5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC120Q96HB5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC120Q96HB5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC120Q96HB5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC120Q96HB5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC120Q96HB5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC120Q96HB5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC120Q96HB5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC120Q96HB5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC120Q96HB5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC120Q96HB5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC120Q96HB5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC120Q96HB5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC120Q96HB5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC120Q96HB5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC120Q96HB5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC120Q96HB5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC120Q96HB5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC120Q96HB5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC120Q96HB5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC120Q96HB5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC120Q96HB5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC120Q96HB5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC120Q96HB5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC120Q96HB5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC120Q96HB5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC120Q96HB5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC120Q96HB5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC120Q96HB5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC120Q96HB5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC120Q96HB5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC120Q96HB5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC120Q96HB5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC120Q96HB5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC120Q96HB5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC120Q96HB5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC120Q96HB5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC120Q96HB5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC120Q96HB5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC120Q96HB5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC120Q96HB5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC120Q96HB5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms