Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC97Q96F63 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC97Q96F63 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC97Q96F63 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC97Q96F63 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC97Q96F63 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC97Q96F63 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC97Q96F63 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC97Q96F63 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC97Q96F63 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC97Q96F63 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC97Q96F63 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC97Q96F63 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC97Q96F63 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC97Q96F63 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC97Q96F63 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC97Q96F63 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC97Q96F63 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC97Q96F63 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC97Q96F63 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC97Q96F63 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC97Q96F63 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC97Q96F63 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC97Q96F63 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC97Q96F63 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC97Q96F63 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC97Q96F63 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC97Q96F63 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC97Q96F63 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC97Q96F63 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC97Q96F63 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC97Q96F63 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC97Q96F63 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC97Q96F63 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC97Q96F63 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC97Q96F63 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC97Q96F63 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC97Q96F63 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC97Q96F63 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC97Q96F63 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC97Q96F63 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC97Q96F63 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC97Q96F63 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC97Q96F63 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC97Q96F63 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC97Q96F63 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC97Q96F63 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC97Q96F63 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC97Q96F63 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC97Q96F63 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC97Q96F63 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC97Q96F63 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC97Q96F63 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC97Q96F63 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC97Q96F63 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC97Q96F63 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC97Q96F63 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC97Q96F63 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC97Q96F63 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC97Q96F63 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC97Q96F63 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC97Q96F63 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC97Q96F63 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC97Q96F63 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC97Q96F63 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC97Q96F63 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC97Q96F63 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC97Q96F63 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC97Q96F63 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC97Q96F63 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC97Q96F63 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC97Q96F63 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC97Q96F63 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC97Q96F63 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC97Q96F63 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC97Q96F63 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC97Q96F63 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC97Q96F63 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC97Q96F63 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC97Q96F63 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC97Q96F63 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC97Q96F63 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC97Q96F63 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC97Q96F63 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC97Q96F63 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC97Q96F63 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC97Q96F63 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC97Q96F63 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC97Q96F63 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC97Q96F63 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC97Q96F63 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC97Q96F63 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC97Q96F63 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC97Q96F63 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC97Q96F63 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC97Q96F63 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC97Q96F63 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC97Q96F63 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC97Q96F63 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC97Q96F63 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms