Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SHISA4Q96DD7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SHISA4Q96DD7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SHISA4Q96DD7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SHISA4Q96DD7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SHISA4Q96DD7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SHISA4Q96DD7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SHISA4Q96DD7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SHISA4Q96DD7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SHISA4Q96DD7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SHISA4Q96DD7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SHISA4Q96DD7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SHISA4Q96DD7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SHISA4Q96DD7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SHISA4Q96DD7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SHISA4Q96DD7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SHISA4Q96DD7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SHISA4Q96DD7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SHISA4Q96DD7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SHISA4Q96DD7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SHISA4Q96DD7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SHISA4Q96DD7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SHISA4Q96DD7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SHISA4Q96DD7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SHISA4Q96DD7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SHISA4Q96DD7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SHISA4Q96DD7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SHISA4Q96DD7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SHISA4Q96DD7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SHISA4Q96DD7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SHISA4Q96DD7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SHISA4Q96DD7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SHISA4Q96DD7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SHISA4Q96DD7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SHISA4Q96DD7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SHISA4Q96DD7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SHISA4Q96DD7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SHISA4Q96DD7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SHISA4Q96DD7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SHISA4Q96DD7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SHISA4Q96DD7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SHISA4Q96DD7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SHISA4Q96DD7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SHISA4Q96DD7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SHISA4Q96DD7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SHISA4Q96DD7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SHISA4Q96DD7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SHISA4Q96DD7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SHISA4Q96DD7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SHISA4Q96DD7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SHISA4Q96DD7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SHISA4Q96DD7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SHISA4Q96DD7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SHISA4Q96DD7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SHISA4Q96DD7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SHISA4Q96DD7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SHISA4Q96DD7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SHISA4Q96DD7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SHISA4Q96DD7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SHISA4Q96DD7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SHISA4Q96DD7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SHISA4Q96DD7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SHISA4Q96DD7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SHISA4Q96DD7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
SHISA4Q96DD7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SHISA4Q96DD7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SHISA4Q96DD7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SHISA4Q96DD7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SHISA4Q96DD7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SHISA4Q96DD7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SHISA4Q96DD7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SHISA4Q96DD7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SHISA4Q96DD7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SHISA4Q96DD7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SHISA4Q96DD7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SHISA4Q96DD7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SHISA4Q96DD7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SHISA4Q96DD7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SHISA4Q96DD7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
SHISA4Q96DD7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
SHISA4Q96DD7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SHISA4Q96DD7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SHISA4Q96DD7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SHISA4Q96DD7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SHISA4Q96DD7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SHISA4Q96DD7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SHISA4Q96DD7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SHISA4Q96DD7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SHISA4Q96DD7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SHISA4Q96DD7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SHISA4Q96DD7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SHISA4Q96DD7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SHISA4Q96DD7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SHISA4Q96DD7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SHISA4Q96DD7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SHISA4Q96DD7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SHISA4Q96DD7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SHISA4Q96DD7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SHISA4Q96DD7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
SHISA4Q96DD7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms